Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.491e-6■■■■■ 56.2
PABPC4Q13310 ARHGAP4-218ENST00000467421 798 ntTSL 223.59■■□□□ 1.371e-6■■■■■ 56.2
PABPC4Q13310 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.261e-6■■■■■ 56.2
PABPC4Q13310 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.261e-6■■■■■ 56.2
PABPC4Q13310 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.26■□□□□ 0.991e-6■■■■■ 56.2
PABPC4Q13310 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.991e-6■■■■■ 56.2
PABPC4Q13310 CLSTN3-202ENST00000331148 2288 ntTSL 1 (best)19.33■□□□□ 0.681e-6■■■■■ 56.2
PABPC4Q13310 AL157935.2-202ENST00000548587 464 ntTSL 419.21■□□□□ 0.671e-6■■■■■ 56.2
PABPC4Q13310 USP45-211ENST00000508908 469 ntTSL 319.03■□□□□ 0.641e-6■■■■■ 56.2
PABPC4Q13310 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.611e-6■■■■■ 56.2
PABPC4Q13310 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.451e-6■■■■■ 56.2
PABPC4Q13310 UPF3A-204ENST00000475218 1791 ntTSL 1 (best)17.05■□□□□ 0.321e-6■■■■■ 56.2
PABPC4Q13310 KDM5B-201ENST00000235790 4418 ntTSL 215.63■□□□□ 0.091e-6■■■■■ 56.2
PABPC4Q13310 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.051e-6■■■■■ 56.2
PABPC4Q13310 ZNF236-206ENST00000583488 629 ntTSL 514.97□□□□□ -0.011e-6■■■■■ 56.2
PABPC4Q13310 SYK-204ENST00000375754 5005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.061e-6■■■■■ 56.2
PABPC4Q13310 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.11e-6■■■■■ 56.2
PABPC4Q13310 TCEAL9-201ENST00000372656 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.161e-6■■■■■ 56.2
PABPC4Q13310 TCEAL9-202ENST00000372661 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.161e-6■■■■■ 56.2
PABPC4Q13310 SDE2-201ENST00000272091 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.241e-6■■■■■ 56.2
PABPC4Q13310 TNRC6C-205ENST00000588061 8419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.281e-6■■■■■ 56.2
PABPC4Q13310 TNRC6C-207ENST00000588847 8527 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.31e-6■■■■■ 56.2
PABPC4Q13310 AL356234.1-201ENST00000404534 1779 ntBASIC13.14□□□□□ -0.311e-6■■■■■ 56.2
PABPC4Q13310 ZNF236-202ENST00000320610 7124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.331e-6■■■■■ 56.2
PABPC4Q13310 TNRC6C-201ENST00000301624 9632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.361e-6■■■■■ 56.2
PABPC4Q13310 CLSTN3-201ENST00000266546 4185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.411e-6■■■■■ 56.2
PABPC4Q13310 PDZD11-203ENST00000473667 630 ntTSL 412.33□□□□□ -0.441e-6■■■■■ 56.2
PABPC4Q13310 SYK-201ENST00000375746 4990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.481e-6■■■■■ 56.2
PABPC4Q13310 CLSTN3-207ENST00000537408 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.521e-6■■■■■ 56.2
PABPC4Q13310 TNRC6C-202ENST00000335749 9740 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.521e-6■■■■■ 56.2
PABPC4Q13310 ZNF236-203ENST00000543926 8206 ntTSL 1 (best)11.77□□□□□ -0.521e-6■■■■■ 56.2
PABPC4Q13310 SYK-202ENST00000375747 4908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61e-6■■■■■ 56.2
PABPC4Q13310 ZNF236-201ENST00000253159 8124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.611e-6■■■■■ 56.2
PABPC4Q13310 TANGO6-201ENST00000261778 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.661e-6■■■■■ 56.2
PABPC4Q13310 KDM5B-210ENST00000602511 542 ntTSL 59.4□□□□□ -0.91e-6■■■■■ 56.2
PABPC4Q13310 CRNDE-214ENST00000637011 865 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.991e-6■■■■■ 56.2
PABPC4Q13310 ECT2-206ENST00000417960 4363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.081e-6■■■■■ 56.2
PABPC4Q13310 RERG-202ENST00000393736 655 ntTSL 38.28□□□□□ -1.081e-6■■■■■ 56.2
PABPC4Q13310 ECT2-201ENST00000232458 4087 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.091e-6■■■■■ 56.2
PABPC4Q13310 CHPT1-203ENST00000546873 624 ntTSL 37.76□□□□□ -1.171e-6■■■■■ 56.2
PABPC4Q13310 PDZD11-204ENST00000486461 416 ntTSL 37.63□□□□□ -1.191e-6■■■■■ 56.2
PABPC4Q13310 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.231e-6■■■■■ 56.2
PABPC4Q13310 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.351e-6■■■■■ 56.2
PABPC4Q13310 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC4.9□□□□□ -1.631e-6■■■■■ 56.2
PABPC4Q13310 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.711e-6■■■■■ 56.2
PABPC4Q13310 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.741e-6■■■■■ 56.2
PABPC4Q13310 AP000781.2-203ENST00000528835 533 ntTSL 320.6■□□□□ 0.892e-12■■■■■ 56
PABPC4Q13310 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.629e-8■■■■■ 55.8
PABPC4Q13310 MAP2K5-209ENST00000558392 1506 ntTSL 523.26■■□□□ 1.319e-8■■■■■ 55.8
PABPC4Q13310 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.239e-8■■■■■ 55.8
PABPC4Q13310 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.19e-8■■■■■ 55.8
PABPC4Q13310 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.459e-8■■■■■ 55.8
PABPC4Q13310 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.268e-9■■■■■ 55.7
PABPC4Q13310 CREB3-202ENST00000486056 1496 ntTSL 220.48■□□□□ 0.878e-9■■■■■ 55.7
PABPC4Q13310 PABPC1-218ENST00000521865 628 ntTSL 225.54■■□□□ 1.681e-323■■■■■ 55.4
PABPC4Q13310 PABPC1-214ENST00000520142 754 ntTSL 313.27□□□□□ -0.291e-323■■■■■ 55.4
PABPC4Q13310 LAMTOR4-210ENST00000488338 533 ntTSL 317.44■□□□□ 0.382e-16■■■■■ 55.4
PABPC4Q13310 PDCD6IP-206ENST00000457054 5962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.31e-17■■■■■ 55.4
PABPC4Q13310 PDCD6IP-201ENST00000307296 6161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.871e-17■■■■■ 55.4
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PABPC4Q13310 BCORL1-205ENST00000540052 7127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.321e-6■■■■■ 55.3
PABPC4Q13310 ASB13-203ENST00000479033 2565 ntTSL 220.71■□□□□ 0.913e-7■■■■■ 55.2
PABPC4Q13310 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.793e-7■■■■■ 55.2
PABPC4Q13310 ASB13-202ENST00000459912 2780 ntTSL 1 (best)18.68■□□□□ 0.583e-7■■■■■ 55.2
PABPC4Q13310 ASB13-205ENST00000493897 683 ntTSL 316.22■□□□□ 0.193e-7■■■■■ 55.2
PABPC4Q13310 IL4I1-208ENST00000601717 2261 ntTSL 1 (best)20.93■□□□□ 0.943e-15■■■■■ 55.1
PABPC4Q13310 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.943e-15■■■■■ 55.1
PABPC4Q13310 IL4I1-206ENST00000596022 747 ntTSL 220.17■□□□□ 0.823e-15■■■■■ 55.1
PABPC4Q13310 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.663e-15■■■■■ 55.1
PABPC4Q13310 IL4I1-207ENST00000597295 651 ntTSL 315.45■□□□□ 0.063e-15■■■■■ 55.1
PABPC4Q13310 IL4I1-205ENST00000596011 714 ntTSL 213.5□□□□□ -0.253e-15■■■■■ 55.1
PABPC4Q13310 NUP62-202ENST00000422090 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.653e-15■■■■■ 55.1
PABPC4Q13310 COMTD1-203ENST00000469299 871 ntTSL 326.46■■□□□ 1.838e-8■■■■■ 55
PABPC4Q13310 COMTD1-204ENST00000470947 796 ntTSL 226.46■■□□□ 1.838e-8■■■■■ 55
PABPC4Q13310 COMTD1-202ENST00000460899 1094 ntTSL 226.46■■□□□ 1.838e-8■■■■■ 55
PABPC4Q13310 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.648e-13■■■■■ 55
PABPC4Q13310 COMTD1-207ENST00000494596 539 ntTSL 223.95■■□□□ 1.428e-8■■■■■ 55
PABPC4Q13310 ABCF3-214ENST00000480562 1182 ntTSL 1 (best)22.99■■□□□ 1.271e-24■■■■■ 55
PABPC4Q13310 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.168e-8■■■■■ 55
PABPC4Q13310 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.18e-13■■■■■ 55
PABPC4Q13310 ABCF3-207ENST00000468892 1360 ntTSL 321.12■□□□□ 0.971e-24■■■■■ 55
PABPC4Q13310 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.61e-24■■■■■ 55
PABPC4Q13310 ABCF3-206ENST00000466742 2331 ntTSL 216.74■□□□□ 0.271e-24■■■■■ 55
PABPC4Q13310 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.091e-24■■■■■ 55
PABPC4Q13310 ABCF3-210ENST00000473311 2844 ntTSL 515.25■□□□□ 0.031e-24■■■■■ 55
PABPC4Q13310 AP000781.2-202ENST00000529411 681 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.11□□□□□ -0.472e-10■■■■■ 55
PABPC4Q13310 MARK4-203ENST00000587566 553 ntTSL 517.58■□□□□ 0.48e-7■■■■■ 54.9
PABPC4Q13310 F2R-201ENST00000319211 3821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.369e-8■■■■■ 54.9
PABPC4Q13310 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.616e-7■■■■■ 54.6
PABPC4Q13310 ERGIC1-211ENST00000523215 3621 ntTSL 1 (best)11.13□□□□□ -0.636e-7■■■■■ 54.6
PABPC4Q13310 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.072e-10■■■■■ 54.6
PABPC4Q13310 SLC25A10-207ENST00000574129 1523 ntTSL 536.07■■■■□ 3.361e-9■■■■■ 54.2
PABPC4Q13310 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.514e-7■■■■■ 54.1
PABPC4Q13310 SLC25A11-204ENST00000574710 2176 ntTSL 223.68■■□□□ 1.384e-7■■■■■ 54.1
PABPC4Q13310 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.281e-8■■■■■ 54.1
PABPC4Q13310 IFT52-204ENST00000461012 399 ntTSL 28.73□□□□□ -1.011e-8■■■■■ 54.1
PABPC4Q13310 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.441e-8■■■■■ 54.1
PABPC4Q13310 IFT52-207ENST00000471199 749 ntTSL 24.87□□□□□ -1.631e-8■■■■■ 54.1
PABPC4Q13310 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.113e-24■■■■■ 54.1
PABPC4Q13310 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.023e-24■■■■■ 54.1
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