Protein–RNA interactions for Protein: Q13113

PDZK1IP1, PDZK1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1IP1Q13113 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDZK1IP1Q13113 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDZK1IP1Q13113 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDZK1IP1Q13113 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDZK1IP1Q13113 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PDZK1IP1Q13113 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDZK1IP1Q13113 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDZK1IP1Q13113 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDZK1IP1Q13113 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDZK1IP1Q13113 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDZK1IP1Q13113 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDZK1IP1Q13113 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDZK1IP1Q13113 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDZK1IP1Q13113 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PDZK1IP1Q13113 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDZK1IP1Q13113 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDZK1IP1Q13113 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDZK1IP1Q13113 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PDZK1IP1Q13113 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDZK1IP1Q13113 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PDZK1IP1Q13113 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDZK1IP1Q13113 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDZK1IP1Q13113 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PDZK1IP1Q13113 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDZK1IP1Q13113 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDZK1IP1Q13113 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDZK1IP1Q13113 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDZK1IP1Q13113 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDZK1IP1Q13113 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDZK1IP1Q13113 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDZK1IP1Q13113 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDZK1IP1Q13113 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDZK1IP1Q13113 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PDZK1IP1Q13113 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PDZK1IP1Q13113 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDZK1IP1Q13113 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDZK1IP1Q13113 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDZK1IP1Q13113 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDZK1IP1Q13113 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDZK1IP1Q13113 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDZK1IP1Q13113 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDZK1IP1Q13113 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDZK1IP1Q13113 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDZK1IP1Q13113 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDZK1IP1Q13113 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDZK1IP1Q13113 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDZK1IP1Q13113 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDZK1IP1Q13113 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDZK1IP1Q13113 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDZK1IP1Q13113 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDZK1IP1Q13113 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PDZK1IP1Q13113 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDZK1IP1Q13113 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDZK1IP1Q13113 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDZK1IP1Q13113 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDZK1IP1Q13113 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDZK1IP1Q13113 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDZK1IP1Q13113 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PDZK1IP1Q13113 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDZK1IP1Q13113 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDZK1IP1Q13113 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDZK1IP1Q13113 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDZK1IP1Q13113 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDZK1IP1Q13113 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDZK1IP1Q13113 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDZK1IP1Q13113 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDZK1IP1Q13113 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDZK1IP1Q13113 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDZK1IP1Q13113 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDZK1IP1Q13113 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDZK1IP1Q13113 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDZK1IP1Q13113 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDZK1IP1Q13113 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDZK1IP1Q13113 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDZK1IP1Q13113 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDZK1IP1Q13113 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDZK1IP1Q13113 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDZK1IP1Q13113 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDZK1IP1Q13113 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDZK1IP1Q13113 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDZK1IP1Q13113 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDZK1IP1Q13113 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDZK1IP1Q13113 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDZK1IP1Q13113 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDZK1IP1Q13113 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PDZK1IP1Q13113 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDZK1IP1Q13113 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDZK1IP1Q13113 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDZK1IP1Q13113 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDZK1IP1Q13113 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDZK1IP1Q13113 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDZK1IP1Q13113 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDZK1IP1Q13113 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDZK1IP1Q13113 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDZK1IP1Q13113 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDZK1IP1Q13113 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PDZK1IP1Q13113 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDZK1IP1Q13113 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDZK1IP1Q13113 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDZK1IP1Q13113 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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