Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CHAF1AQ13111 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CHAF1AQ13111 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CHAF1AQ13111 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CHAF1AQ13111 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CHAF1AQ13111 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CHAF1AQ13111 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CHAF1AQ13111 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CHAF1AQ13111 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CHAF1AQ13111 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CHAF1AQ13111 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CHAF1AQ13111 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
CHAF1AQ13111 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CHAF1AQ13111 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CHAF1AQ13111 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CHAF1AQ13111 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CHAF1AQ13111 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CHAF1AQ13111 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CHAF1AQ13111 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CHAF1AQ13111 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CHAF1AQ13111 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CHAF1AQ13111 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CHAF1AQ13111 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CHAF1AQ13111 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CHAF1AQ13111 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CHAF1AQ13111 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CHAF1AQ13111 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CHAF1AQ13111 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
CHAF1AQ13111 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CHAF1AQ13111 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CHAF1AQ13111 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CHAF1AQ13111 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CHAF1AQ13111 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CHAF1AQ13111 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CHAF1AQ13111 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CHAF1AQ13111 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CHAF1AQ13111 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CHAF1AQ13111 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CHAF1AQ13111 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CHAF1AQ13111 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CHAF1AQ13111 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CHAF1AQ13111 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
CHAF1AQ13111 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CHAF1AQ13111 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CHAF1AQ13111 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CHAF1AQ13111 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CHAF1AQ13111 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CHAF1AQ13111 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CHAF1AQ13111 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CHAF1AQ13111 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CHAF1AQ13111 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.56
CHAF1AQ13111 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
CHAF1AQ13111 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
CHAF1AQ13111 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CHAF1AQ13111 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CHAF1AQ13111 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CHAF1AQ13111 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
CHAF1AQ13111 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CHAF1AQ13111 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CHAF1AQ13111 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CHAF1AQ13111 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CHAF1AQ13111 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CHAF1AQ13111 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CHAF1AQ13111 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CHAF1AQ13111 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CHAF1AQ13111 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CHAF1AQ13111 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CHAF1AQ13111 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
CHAF1AQ13111 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CHAF1AQ13111 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CHAF1AQ13111 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
CHAF1AQ13111 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CHAF1AQ13111 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CHAF1AQ13111 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
CHAF1AQ13111 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CHAF1AQ13111 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CHAF1AQ13111 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
CHAF1AQ13111 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
CHAF1AQ13111 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CHAF1AQ13111 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CHAF1AQ13111 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CHAF1AQ13111 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CHAF1AQ13111 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CHAF1AQ13111 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CHAF1AQ13111 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CHAF1AQ13111 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CHAF1AQ13111 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CHAF1AQ13111 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CHAF1AQ13111 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CHAF1AQ13111 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CHAF1AQ13111 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CHAF1AQ13111 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CHAF1AQ13111 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CHAF1AQ13111 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
CHAF1AQ13111 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CHAF1AQ13111 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CHAF1AQ13111 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CHAF1AQ13111 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CHAF1AQ13111 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CHAF1AQ13111 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
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