Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CHAF1AQ13111 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CHAF1AQ13111 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CHAF1AQ13111 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CHAF1AQ13111 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CHAF1AQ13111 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CHAF1AQ13111 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CHAF1AQ13111 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CHAF1AQ13111 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CHAF1AQ13111 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CHAF1AQ13111 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CHAF1AQ13111 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
CHAF1AQ13111 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CHAF1AQ13111 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CHAF1AQ13111 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CHAF1AQ13111 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CHAF1AQ13111 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CHAF1AQ13111 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CHAF1AQ13111 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CHAF1AQ13111 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CHAF1AQ13111 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CHAF1AQ13111 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CHAF1AQ13111 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CHAF1AQ13111 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CHAF1AQ13111 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CHAF1AQ13111 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CHAF1AQ13111 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CHAF1AQ13111 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
CHAF1AQ13111 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CHAF1AQ13111 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CHAF1AQ13111 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CHAF1AQ13111 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CHAF1AQ13111 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CHAF1AQ13111 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CHAF1AQ13111 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CHAF1AQ13111 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CHAF1AQ13111 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CHAF1AQ13111 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CHAF1AQ13111 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CHAF1AQ13111 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CHAF1AQ13111 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CHAF1AQ13111 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
CHAF1AQ13111 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CHAF1AQ13111 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CHAF1AQ13111 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CHAF1AQ13111 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CHAF1AQ13111 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CHAF1AQ13111 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CHAF1AQ13111 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CHAF1AQ13111 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CHAF1AQ13111 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.56
CHAF1AQ13111 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
CHAF1AQ13111 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
CHAF1AQ13111 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CHAF1AQ13111 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CHAF1AQ13111 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CHAF1AQ13111 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
CHAF1AQ13111 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CHAF1AQ13111 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CHAF1AQ13111 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CHAF1AQ13111 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CHAF1AQ13111 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CHAF1AQ13111 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CHAF1AQ13111 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CHAF1AQ13111 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CHAF1AQ13111 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CHAF1AQ13111 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CHAF1AQ13111 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
CHAF1AQ13111 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CHAF1AQ13111 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CHAF1AQ13111 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
CHAF1AQ13111 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CHAF1AQ13111 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CHAF1AQ13111 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
CHAF1AQ13111 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CHAF1AQ13111 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CHAF1AQ13111 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
CHAF1AQ13111 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
CHAF1AQ13111 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CHAF1AQ13111 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CHAF1AQ13111 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CHAF1AQ13111 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CHAF1AQ13111 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CHAF1AQ13111 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CHAF1AQ13111 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CHAF1AQ13111 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CHAF1AQ13111 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CHAF1AQ13111 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CHAF1AQ13111 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CHAF1AQ13111 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CHAF1AQ13111 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CHAF1AQ13111 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CHAF1AQ13111 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CHAF1AQ13111 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
CHAF1AQ13111 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CHAF1AQ13111 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CHAF1AQ13111 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CHAF1AQ13111 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CHAF1AQ13111 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CHAF1AQ13111 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
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