Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
APOBRQ0VD83 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
APOBRQ0VD83 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
APOBRQ0VD83 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
APOBRQ0VD83 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
APOBRQ0VD83 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
APOBRQ0VD83 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
APOBRQ0VD83 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
APOBRQ0VD83 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
APOBRQ0VD83 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
APOBRQ0VD83 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
APOBRQ0VD83 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
APOBRQ0VD83 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
APOBRQ0VD83 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
APOBRQ0VD83 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
APOBRQ0VD83 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
APOBRQ0VD83 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
APOBRQ0VD83 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
APOBRQ0VD83 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
APOBRQ0VD83 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
APOBRQ0VD83 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
APOBRQ0VD83 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
APOBRQ0VD83 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
APOBRQ0VD83 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
APOBRQ0VD83 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
APOBRQ0VD83 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
APOBRQ0VD83 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
APOBRQ0VD83 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
APOBRQ0VD83 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
APOBRQ0VD83 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
APOBRQ0VD83 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
APOBRQ0VD83 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
APOBRQ0VD83 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
APOBRQ0VD83 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
APOBRQ0VD83 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
APOBRQ0VD83 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
APOBRQ0VD83 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
APOBRQ0VD83 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
APOBRQ0VD83 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
APOBRQ0VD83 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
APOBRQ0VD83 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
APOBRQ0VD83 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
APOBRQ0VD83 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
APOBRQ0VD83 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
APOBRQ0VD83 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
APOBRQ0VD83 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
APOBRQ0VD83 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
APOBRQ0VD83 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
APOBRQ0VD83 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
APOBRQ0VD83 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
APOBRQ0VD83 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
APOBRQ0VD83 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
APOBRQ0VD83 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
APOBRQ0VD83 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
APOBRQ0VD83 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
APOBRQ0VD83 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.75■■■□□ 2.35
APOBRQ0VD83 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
APOBRQ0VD83 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
APOBRQ0VD83 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
APOBRQ0VD83 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
APOBRQ0VD83 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
APOBRQ0VD83 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
APOBRQ0VD83 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
APOBRQ0VD83 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
APOBRQ0VD83 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
APOBRQ0VD83 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
APOBRQ0VD83 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
APOBRQ0VD83 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
APOBRQ0VD83 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
APOBRQ0VD83 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
APOBRQ0VD83 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
APOBRQ0VD83 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
APOBRQ0VD83 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
APOBRQ0VD83 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
APOBRQ0VD83 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
APOBRQ0VD83 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
APOBRQ0VD83 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
APOBRQ0VD83 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
APOBRQ0VD83 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
APOBRQ0VD83 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
APOBRQ0VD83 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
APOBRQ0VD83 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
APOBRQ0VD83 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
APOBRQ0VD83 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
APOBRQ0VD83 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
APOBRQ0VD83 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
APOBRQ0VD83 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
APOBRQ0VD83 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
APOBRQ0VD83 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
APOBRQ0VD83 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
APOBRQ0VD83 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
APOBRQ0VD83 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
APOBRQ0VD83 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
APOBRQ0VD83 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
APOBRQ0VD83 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
APOBRQ0VD83 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
APOBRQ0VD83 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
APOBRQ0VD83 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
APOBRQ0VD83 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
APOBRQ0VD83 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms