Protein–RNA interactions for Protein: Q07912

TNK2, Activated CDC42 kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNK2Q07912 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TNK2Q07912 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TNK2Q07912 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TNK2Q07912 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TNK2Q07912 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TNK2Q07912 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TNK2Q07912 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNK2Q07912 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNK2Q07912 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNK2Q07912 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNK2Q07912 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNK2Q07912 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNK2Q07912 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNK2Q07912 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNK2Q07912 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNK2Q07912 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNK2Q07912 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNK2Q07912 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TNK2Q07912 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNK2Q07912 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNK2Q07912 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNK2Q07912 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNK2Q07912 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNK2Q07912 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNK2Q07912 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNK2Q07912 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TNK2Q07912 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNK2Q07912 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNK2Q07912 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNK2Q07912 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNK2Q07912 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNK2Q07912 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNK2Q07912 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNK2Q07912 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNK2Q07912 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNK2Q07912 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNK2Q07912 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNK2Q07912 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TNK2Q07912 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TNK2Q07912 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNK2Q07912 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNK2Q07912 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNK2Q07912 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNK2Q07912 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNK2Q07912 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNK2Q07912 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNK2Q07912 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNK2Q07912 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNK2Q07912 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNK2Q07912 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNK2Q07912 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNK2Q07912 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TNK2Q07912 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNK2Q07912 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNK2Q07912 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNK2Q07912 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNK2Q07912 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNK2Q07912 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNK2Q07912 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNK2Q07912 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNK2Q07912 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNK2Q07912 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TNK2Q07912 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNK2Q07912 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNK2Q07912 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNK2Q07912 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNK2Q07912 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNK2Q07912 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNK2Q07912 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNK2Q07912 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNK2Q07912 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TNK2Q07912 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNK2Q07912 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TNK2Q07912 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNK2Q07912 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNK2Q07912 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNK2Q07912 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNK2Q07912 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNK2Q07912 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNK2Q07912 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNK2Q07912 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNK2Q07912 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNK2Q07912 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNK2Q07912 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNK2Q07912 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNK2Q07912 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNK2Q07912 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNK2Q07912 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNK2Q07912 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNK2Q07912 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TNK2Q07912 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TNK2Q07912 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNK2Q07912 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNK2Q07912 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNK2Q07912 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNK2Q07912 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNK2Q07912 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNK2Q07912 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNK2Q07912 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNK2Q07912 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms