Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CD164Q04900 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CD164Q04900 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CD164Q04900 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CD164Q04900 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CD164Q04900 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CD164Q04900 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CD164Q04900 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD164Q04900 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD164Q04900 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD164Q04900 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD164Q04900 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CD164Q04900 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD164Q04900 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD164Q04900 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD164Q04900 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD164Q04900 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD164Q04900 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD164Q04900 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD164Q04900 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD164Q04900 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CD164Q04900 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CD164Q04900 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CD164Q04900 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CD164Q04900 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CD164Q04900 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CD164Q04900 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CD164Q04900 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CD164Q04900 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CD164Q04900 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CD164Q04900 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CD164Q04900 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CD164Q04900 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CD164Q04900 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CD164Q04900 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CD164Q04900 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CD164Q04900 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CD164Q04900 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CD164Q04900 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CD164Q04900 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CD164Q04900 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CD164Q04900 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CD164Q04900 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CD164Q04900 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CD164Q04900 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD164Q04900 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD164Q04900 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD164Q04900 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD164Q04900 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD164Q04900 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CD164Q04900 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CD164Q04900 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CD164Q04900 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CD164Q04900 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CD164Q04900 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CD164Q04900 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CD164Q04900 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CD164Q04900 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CD164Q04900 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CD164Q04900 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CD164Q04900 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CD164Q04900 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CD164Q04900 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CD164Q04900 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CD164Q04900 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CD164Q04900 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CD164Q04900 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CD164Q04900 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CD164Q04900 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CD164Q04900 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CD164Q04900 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CD164Q04900 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CD164Q04900 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CD164Q04900 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CD164Q04900 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CD164Q04900 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CD164Q04900 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CD164Q04900 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CD164Q04900 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CD164Q04900 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CD164Q04900 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CD164Q04900 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CD164Q04900 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CD164Q04900 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CD164Q04900 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CD164Q04900 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CD164Q04900 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CD164Q04900 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CD164Q04900 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CD164Q04900 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CD164Q04900 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CD164Q04900 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CD164Q04900 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CD164Q04900 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CD164Q04900 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
CD164Q04900 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CD164Q04900 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CD164Q04900 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CD164Q04900 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CD164Q04900 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 239.6 ms