Protein–RNA interactions for Protein: Q02575

NHLH1, Helix-loop-helix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH1Q02575 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NHLH1Q02575 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NHLH1Q02575 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NHLH1Q02575 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NHLH1Q02575 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NHLH1Q02575 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NHLH1Q02575 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NHLH1Q02575 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NHLH1Q02575 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NHLH1Q02575 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NHLH1Q02575 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NHLH1Q02575 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NHLH1Q02575 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NHLH1Q02575 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NHLH1Q02575 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NHLH1Q02575 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NHLH1Q02575 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NHLH1Q02575 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NHLH1Q02575 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NHLH1Q02575 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NHLH1Q02575 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NHLH1Q02575 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NHLH1Q02575 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NHLH1Q02575 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NHLH1Q02575 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NHLH1Q02575 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NHLH1Q02575 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NHLH1Q02575 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NHLH1Q02575 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NHLH1Q02575 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NHLH1Q02575 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NHLH1Q02575 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NHLH1Q02575 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NHLH1Q02575 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NHLH1Q02575 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NHLH1Q02575 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NHLH1Q02575 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NHLH1Q02575 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NHLH1Q02575 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NHLH1Q02575 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NHLH1Q02575 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NHLH1Q02575 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NHLH1Q02575 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NHLH1Q02575 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NHLH1Q02575 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NHLH1Q02575 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NHLH1Q02575 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NHLH1Q02575 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NHLH1Q02575 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NHLH1Q02575 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NHLH1Q02575 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NHLH1Q02575 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NHLH1Q02575 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NHLH1Q02575 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NHLH1Q02575 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NHLH1Q02575 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NHLH1Q02575 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NHLH1Q02575 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NHLH1Q02575 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NHLH1Q02575 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NHLH1Q02575 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NHLH1Q02575 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NHLH1Q02575 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NHLH1Q02575 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NHLH1Q02575 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NHLH1Q02575 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NHLH1Q02575 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NHLH1Q02575 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NHLH1Q02575 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NHLH1Q02575 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NHLH1Q02575 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NHLH1Q02575 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NHLH1Q02575 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NHLH1Q02575 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NHLH1Q02575 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NHLH1Q02575 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NHLH1Q02575 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NHLH1Q02575 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NHLH1Q02575 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NHLH1Q02575 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NHLH1Q02575 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NHLH1Q02575 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NHLH1Q02575 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NHLH1Q02575 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NHLH1Q02575 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NHLH1Q02575 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NHLH1Q02575 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NHLH1Q02575 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NHLH1Q02575 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NHLH1Q02575 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NHLH1Q02575 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NHLH1Q02575 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NHLH1Q02575 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NHLH1Q02575 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NHLH1Q02575 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NHLH1Q02575 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NHLH1Q02575 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NHLH1Q02575 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NHLH1Q02575 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NHLH1Q02575 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.1 ms