Protein–RNA interactions for Protein: Q02575

NHLH1, Helix-loop-helix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH1Q02575 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NHLH1Q02575 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NHLH1Q02575 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NHLH1Q02575 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NHLH1Q02575 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NHLH1Q02575 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NHLH1Q02575 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NHLH1Q02575 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NHLH1Q02575 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NHLH1Q02575 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NHLH1Q02575 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NHLH1Q02575 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NHLH1Q02575 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NHLH1Q02575 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NHLH1Q02575 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NHLH1Q02575 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NHLH1Q02575 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NHLH1Q02575 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NHLH1Q02575 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NHLH1Q02575 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NHLH1Q02575 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NHLH1Q02575 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NHLH1Q02575 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NHLH1Q02575 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NHLH1Q02575 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NHLH1Q02575 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NHLH1Q02575 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NHLH1Q02575 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NHLH1Q02575 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NHLH1Q02575 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NHLH1Q02575 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NHLH1Q02575 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NHLH1Q02575 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NHLH1Q02575 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NHLH1Q02575 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NHLH1Q02575 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NHLH1Q02575 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NHLH1Q02575 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NHLH1Q02575 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NHLH1Q02575 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NHLH1Q02575 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NHLH1Q02575 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NHLH1Q02575 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NHLH1Q02575 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NHLH1Q02575 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NHLH1Q02575 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NHLH1Q02575 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NHLH1Q02575 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NHLH1Q02575 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NHLH1Q02575 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NHLH1Q02575 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NHLH1Q02575 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NHLH1Q02575 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NHLH1Q02575 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NHLH1Q02575 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NHLH1Q02575 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NHLH1Q02575 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NHLH1Q02575 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NHLH1Q02575 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NHLH1Q02575 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NHLH1Q02575 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NHLH1Q02575 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NHLH1Q02575 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NHLH1Q02575 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NHLH1Q02575 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NHLH1Q02575 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NHLH1Q02575 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NHLH1Q02575 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NHLH1Q02575 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NHLH1Q02575 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NHLH1Q02575 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NHLH1Q02575 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NHLH1Q02575 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NHLH1Q02575 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NHLH1Q02575 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NHLH1Q02575 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NHLH1Q02575 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NHLH1Q02575 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NHLH1Q02575 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NHLH1Q02575 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NHLH1Q02575 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NHLH1Q02575 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NHLH1Q02575 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NHLH1Q02575 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NHLH1Q02575 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NHLH1Q02575 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NHLH1Q02575 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NHLH1Q02575 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NHLH1Q02575 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NHLH1Q02575 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NHLH1Q02575 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NHLH1Q02575 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NHLH1Q02575 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NHLH1Q02575 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NHLH1Q02575 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NHLH1Q02575 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NHLH1Q02575 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NHLH1Q02575 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NHLH1Q02575 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NHLH1Q02575 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms