Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SKOR1P84550 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SKOR1P84550 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SKOR1P84550 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SKOR1P84550 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SKOR1P84550 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SKOR1P84550 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SKOR1P84550 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SKOR1P84550 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SKOR1P84550 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SKOR1P84550 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SKOR1P84550 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SKOR1P84550 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SKOR1P84550 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SKOR1P84550 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SKOR1P84550 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SKOR1P84550 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SKOR1P84550 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SKOR1P84550 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SKOR1P84550 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SKOR1P84550 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SKOR1P84550 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SKOR1P84550 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SKOR1P84550 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SKOR1P84550 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SKOR1P84550 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SKOR1P84550 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SKOR1P84550 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SKOR1P84550 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SKOR1P84550 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SKOR1P84550 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SKOR1P84550 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SKOR1P84550 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SKOR1P84550 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SKOR1P84550 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SKOR1P84550 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SKOR1P84550 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SKOR1P84550 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SKOR1P84550 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SKOR1P84550 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SKOR1P84550 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SKOR1P84550 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SKOR1P84550 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SKOR1P84550 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SKOR1P84550 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SKOR1P84550 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SKOR1P84550 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SKOR1P84550 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SKOR1P84550 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SKOR1P84550 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SKOR1P84550 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SKOR1P84550 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SKOR1P84550 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SKOR1P84550 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SKOR1P84550 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SKOR1P84550 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SKOR1P84550 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SKOR1P84550 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SKOR1P84550 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SKOR1P84550 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SKOR1P84550 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SKOR1P84550 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SKOR1P84550 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SKOR1P84550 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SKOR1P84550 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SKOR1P84550 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SKOR1P84550 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SKOR1P84550 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SKOR1P84550 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SKOR1P84550 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SKOR1P84550 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SKOR1P84550 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SKOR1P84550 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SKOR1P84550 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SKOR1P84550 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SKOR1P84550 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SKOR1P84550 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SKOR1P84550 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SKOR1P84550 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SKOR1P84550 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SKOR1P84550 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SKOR1P84550 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SKOR1P84550 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SKOR1P84550 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SKOR1P84550 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SKOR1P84550 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SKOR1P84550 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SKOR1P84550 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SKOR1P84550 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SKOR1P84550 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SKOR1P84550 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SKOR1P84550 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SKOR1P84550 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SKOR1P84550 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SKOR1P84550 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SKOR1P84550 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SKOR1P84550 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SKOR1P84550 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SKOR1P84550 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SKOR1P84550 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms