Protein–RNA interactions for Protein: P78406

RAE1, mRNA export factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAE1P78406 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAE1P78406 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAE1P78406 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAE1P78406 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAE1P78406 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAE1P78406 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAE1P78406 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAE1P78406 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RAE1P78406 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAE1P78406 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAE1P78406 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAE1P78406 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAE1P78406 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAE1P78406 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAE1P78406 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAE1P78406 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAE1P78406 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAE1P78406 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAE1P78406 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAE1P78406 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAE1P78406 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAE1P78406 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAE1P78406 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAE1P78406 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAE1P78406 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAE1P78406 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAE1P78406 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RAE1P78406 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAE1P78406 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAE1P78406 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAE1P78406 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAE1P78406 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAE1P78406 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAE1P78406 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAE1P78406 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAE1P78406 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAE1P78406 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RAE1P78406 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAE1P78406 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAE1P78406 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAE1P78406 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAE1P78406 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAE1P78406 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RAE1P78406 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAE1P78406 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAE1P78406 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAE1P78406 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAE1P78406 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAE1P78406 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAE1P78406 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAE1P78406 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAE1P78406 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAE1P78406 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAE1P78406 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAE1P78406 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAE1P78406 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAE1P78406 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAE1P78406 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAE1P78406 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAE1P78406 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAE1P78406 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAE1P78406 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAE1P78406 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAE1P78406 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAE1P78406 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAE1P78406 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAE1P78406 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAE1P78406 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RAE1P78406 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAE1P78406 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAE1P78406 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAE1P78406 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAE1P78406 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAE1P78406 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAE1P78406 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAE1P78406 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAE1P78406 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAE1P78406 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAE1P78406 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAE1P78406 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAE1P78406 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAE1P78406 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAE1P78406 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAE1P78406 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAE1P78406 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAE1P78406 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAE1P78406 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAE1P78406 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAE1P78406 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAE1P78406 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAE1P78406 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAE1P78406 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAE1P78406 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAE1P78406 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAE1P78406 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RAE1P78406 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAE1P78406 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAE1P78406 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAE1P78406 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RAE1P78406 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms