Protein–RNA interactions for Protein: P78395

PRAME, Melanoma antigen preferentially expressed in tumors, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEP78395 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PRAMEP78395 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRAMEP78395 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PRAMEP78395 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRAMEP78395 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRAMEP78395 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRAMEP78395 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRAMEP78395 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRAMEP78395 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRAMEP78395 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRAMEP78395 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRAMEP78395 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PRAMEP78395 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRAMEP78395 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRAMEP78395 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRAMEP78395 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEP78395 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEP78395 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRAMEP78395 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRAMEP78395 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRAMEP78395 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRAMEP78395 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRAMEP78395 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRAMEP78395 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRAMEP78395 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRAMEP78395 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAMEP78395 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAMEP78395 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAMEP78395 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAMEP78395 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAMEP78395 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRAMEP78395 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRAMEP78395 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRAMEP78395 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRAMEP78395 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRAMEP78395 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRAMEP78395 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRAMEP78395 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRAMEP78395 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PRAMEP78395 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRAMEP78395 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRAMEP78395 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRAMEP78395 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRAMEP78395 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRAMEP78395 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRAMEP78395 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRAMEP78395 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRAMEP78395 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRAMEP78395 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRAMEP78395 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRAMEP78395 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRAMEP78395 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRAMEP78395 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRAMEP78395 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRAMEP78395 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRAMEP78395 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRAMEP78395 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRAMEP78395 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRAMEP78395 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRAMEP78395 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRAMEP78395 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRAMEP78395 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRAMEP78395 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRAMEP78395 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRAMEP78395 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRAMEP78395 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRAMEP78395 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRAMEP78395 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRAMEP78395 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRAMEP78395 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRAMEP78395 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRAMEP78395 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRAMEP78395 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRAMEP78395 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRAMEP78395 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRAMEP78395 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRAMEP78395 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRAMEP78395 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRAMEP78395 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRAMEP78395 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRAMEP78395 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRAMEP78395 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRAMEP78395 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRAMEP78395 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRAMEP78395 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRAMEP78395 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRAMEP78395 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PRAMEP78395 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PRAMEP78395 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRAMEP78395 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRAMEP78395 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRAMEP78395 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRAMEP78395 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRAMEP78395 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRAMEP78395 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRAMEP78395 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRAMEP78395 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRAMEP78395 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRAMEP78395 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRAMEP78395 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms