Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ASIC1P78348 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ASIC1P78348 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ASIC1P78348 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ASIC1P78348 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ASIC1P78348 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ASIC1P78348 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ASIC1P78348 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ASIC1P78348 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ASIC1P78348 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ASIC1P78348 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ASIC1P78348 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ASIC1P78348 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ASIC1P78348 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ASIC1P78348 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ASIC1P78348 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ASIC1P78348 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ASIC1P78348 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ASIC1P78348 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ASIC1P78348 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ASIC1P78348 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ASIC1P78348 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ASIC1P78348 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ASIC1P78348 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ASIC1P78348 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ASIC1P78348 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ASIC1P78348 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ASIC1P78348 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ASIC1P78348 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ASIC1P78348 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ASIC1P78348 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ASIC1P78348 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ASIC1P78348 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ASIC1P78348 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ASIC1P78348 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ASIC1P78348 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ASIC1P78348 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ASIC1P78348 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ASIC1P78348 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ASIC1P78348 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ASIC1P78348 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ASIC1P78348 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ASIC1P78348 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ASIC1P78348 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ASIC1P78348 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ASIC1P78348 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ASIC1P78348 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ASIC1P78348 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ASIC1P78348 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ASIC1P78348 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ASIC1P78348 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ASIC1P78348 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ASIC1P78348 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ASIC1P78348 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ASIC1P78348 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ASIC1P78348 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ASIC1P78348 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ASIC1P78348 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ASIC1P78348 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ASIC1P78348 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ASIC1P78348 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ASIC1P78348 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ASIC1P78348 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ASIC1P78348 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ASIC1P78348 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ASIC1P78348 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ASIC1P78348 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ASIC1P78348 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ASIC1P78348 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ASIC1P78348 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ASIC1P78348 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ASIC1P78348 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ASIC1P78348 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ASIC1P78348 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ASIC1P78348 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ASIC1P78348 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ASIC1P78348 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ASIC1P78348 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ASIC1P78348 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ASIC1P78348 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ASIC1P78348 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ASIC1P78348 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ASIC1P78348 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ASIC1P78348 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ASIC1P78348 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ASIC1P78348 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ASIC1P78348 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ASIC1P78348 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ASIC1P78348 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ASIC1P78348 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ASIC1P78348 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ASIC1P78348 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ASIC1P78348 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ASIC1P78348 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ASIC1P78348 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ASIC1P78348 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ASIC1P78348 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ASIC1P78348 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ASIC1P78348 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ASIC1P78348 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms