Protein–RNA interactions for Protein: P68104

EEF1A1, Elongation factor 1-alpha 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P68104 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EEF1A1P68104 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EEF1A1P68104 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EEF1A1P68104 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EEF1A1P68104 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EEF1A1P68104 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EEF1A1P68104 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EEF1A1P68104 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
EEF1A1P68104 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EEF1A1P68104 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
EEF1A1P68104 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
EEF1A1P68104 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EEF1A1P68104 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EEF1A1P68104 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EEF1A1P68104 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EEF1A1P68104 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EEF1A1P68104 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EEF1A1P68104 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EEF1A1P68104 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EEF1A1P68104 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
EEF1A1P68104 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EEF1A1P68104 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EEF1A1P68104 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EEF1A1P68104 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EEF1A1P68104 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EEF1A1P68104 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EEF1A1P68104 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EEF1A1P68104 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EEF1A1P68104 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EEF1A1P68104 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EEF1A1P68104 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EEF1A1P68104 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EEF1A1P68104 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EEF1A1P68104 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
EEF1A1P68104 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EEF1A1P68104 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EEF1A1P68104 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EEF1A1P68104 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
EEF1A1P68104 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EEF1A1P68104 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EEF1A1P68104 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EEF1A1P68104 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EEF1A1P68104 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EEF1A1P68104 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EEF1A1P68104 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EEF1A1P68104 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EEF1A1P68104 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EEF1A1P68104 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EEF1A1P68104 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EEF1A1P68104 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EEF1A1P68104 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EEF1A1P68104 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EEF1A1P68104 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EEF1A1P68104 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EEF1A1P68104 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EEF1A1P68104 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EEF1A1P68104 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EEF1A1P68104 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
EEF1A1P68104 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EEF1A1P68104 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EEF1A1P68104 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EEF1A1P68104 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EEF1A1P68104 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EEF1A1P68104 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EEF1A1P68104 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EEF1A1P68104 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EEF1A1P68104 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EEF1A1P68104 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EEF1A1P68104 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EEF1A1P68104 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EEF1A1P68104 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EEF1A1P68104 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EEF1A1P68104 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EEF1A1P68104 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EEF1A1P68104 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
EEF1A1P68104 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EEF1A1P68104 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EEF1A1P68104 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EEF1A1P68104 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EEF1A1P68104 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EEF1A1P68104 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EEF1A1P68104 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EEF1A1P68104 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EEF1A1P68104 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EEF1A1P68104 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EEF1A1P68104 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EEF1A1P68104 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EEF1A1P68104 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EEF1A1P68104 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EEF1A1P68104 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EEF1A1P68104 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EEF1A1P68104 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EEF1A1P68104 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EEF1A1P68104 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EEF1A1P68104 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EEF1A1P68104 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EEF1A1P68104 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EEF1A1P68104 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EEF1A1P68104 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EEF1A1P68104 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms