Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPL23P62829 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPL23P62829 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPL23P62829 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPL23P62829 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPL23P62829 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPL23P62829 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPL23P62829 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPL23P62829 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPL23P62829 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPL23P62829 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPL23P62829 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPL23P62829 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPL23P62829 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPL23P62829 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPL23P62829 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPL23P62829 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPL23P62829 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPL23P62829 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPL23P62829 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPL23P62829 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPL23P62829 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPL23P62829 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPL23P62829 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPL23P62829 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPL23P62829 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPL23P62829 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPL23P62829 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPL23P62829 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPL23P62829 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPL23P62829 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPL23P62829 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPL23P62829 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPL23P62829 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPL23P62829 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPL23P62829 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPL23P62829 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPL23P62829 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPL23P62829 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPL23P62829 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPL23P62829 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPL23P62829 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPL23P62829 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RPL23P62829 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPL23P62829 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPL23P62829 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPL23P62829 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPL23P62829 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPL23P62829 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPL23P62829 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RPL23P62829 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPL23P62829 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPL23P62829 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPL23P62829 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPL23P62829 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPL23P62829 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPL23P62829 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPL23P62829 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPL23P62829 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPL23P62829 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPL23P62829 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPL23P62829 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPL23P62829 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPL23P62829 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPL23P62829 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPL23P62829 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPL23P62829 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPL23P62829 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPL23P62829 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPL23P62829 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RPL23P62829 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RPL23P62829 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RPL23P62829 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPL23P62829 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPL23P62829 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPL23P62829 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPL23P62829 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPL23P62829 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPL23P62829 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RPL23P62829 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RPL23P62829 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RPL23P62829 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RPL23P62829 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPL23P62829 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPL23P62829 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPL23P62829 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPL23P62829 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPL23P62829 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPL23P62829 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPL23P62829 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPL23P62829 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
RPL23P62829 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
RPL23P62829 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPL23P62829 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPL23P62829 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RPL23P62829 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RPL23P62829 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RPL23P62829 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
RPL23P62829 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RPL23P62829 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms