Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LOXL3P58215 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LOXL3P58215 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LOXL3P58215 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LOXL3P58215 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LOXL3P58215 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
LOXL3P58215 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LOXL3P58215 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.95■□□□□ 0.95
LOXL3P58215 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LOXL3P58215 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LOXL3P58215 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LOXL3P58215 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LOXL3P58215 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LOXL3P58215 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LOXL3P58215 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
LOXL3P58215 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LOXL3P58215 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LOXL3P58215 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LOXL3P58215 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LOXL3P58215 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LOXL3P58215 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LOXL3P58215 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LOXL3P58215 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LOXL3P58215 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LOXL3P58215 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LOXL3P58215 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LOXL3P58215 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LOXL3P58215 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LOXL3P58215 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LOXL3P58215 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LOXL3P58215 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LOXL3P58215 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LOXL3P58215 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LOXL3P58215 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LOXL3P58215 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LOXL3P58215 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
LOXL3P58215 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LOXL3P58215 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LOXL3P58215 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LOXL3P58215 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
LOXL3P58215 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LOXL3P58215 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LOXL3P58215 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LOXL3P58215 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LOXL3P58215 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LOXL3P58215 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LOXL3P58215 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LOXL3P58215 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LOXL3P58215 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LOXL3P58215 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LOXL3P58215 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LOXL3P58215 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LOXL3P58215 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LOXL3P58215 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LOXL3P58215 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LOXL3P58215 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
LOXL3P58215 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LOXL3P58215 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LOXL3P58215 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LOXL3P58215 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LOXL3P58215 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LOXL3P58215 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LOXL3P58215 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LOXL3P58215 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LOXL3P58215 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LOXL3P58215 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LOXL3P58215 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LOXL3P58215 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LOXL3P58215 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LOXL3P58215 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LOXL3P58215 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LOXL3P58215 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LOXL3P58215 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LOXL3P58215 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LOXL3P58215 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LOXL3P58215 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LOXL3P58215 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
LOXL3P58215 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LOXL3P58215 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LOXL3P58215 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LOXL3P58215 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LOXL3P58215 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LOXL3P58215 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
LOXL3P58215 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LOXL3P58215 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LOXL3P58215 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LOXL3P58215 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LOXL3P58215 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LOXL3P58215 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LOXL3P58215 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LOXL3P58215 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LOXL3P58215 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LOXL3P58215 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LOXL3P58215 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LOXL3P58215 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LOXL3P58215 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LOXL3P58215 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LOXL3P58215 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LOXL3P58215 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LOXL3P58215 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms