Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP1B3P54709 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP1B3P54709 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP1B3P54709 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP1B3P54709 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP1B3P54709 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP1B3P54709 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP1B3P54709 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP1B3P54709 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP1B3P54709 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP1B3P54709 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP1B3P54709 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP1B3P54709 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP1B3P54709 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP1B3P54709 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP1B3P54709 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP1B3P54709 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATP1B3P54709 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATP1B3P54709 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP1B3P54709 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP1B3P54709 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP1B3P54709 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP1B3P54709 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP1B3P54709 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP1B3P54709 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP1B3P54709 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP1B3P54709 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP1B3P54709 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP1B3P54709 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP1B3P54709 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP1B3P54709 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP1B3P54709 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP1B3P54709 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP1B3P54709 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP1B3P54709 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP1B3P54709 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP1B3P54709 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP1B3P54709 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP1B3P54709 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP1B3P54709 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP1B3P54709 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP1B3P54709 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP1B3P54709 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP1B3P54709 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP1B3P54709 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP1B3P54709 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP1B3P54709 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP1B3P54709 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP1B3P54709 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP1B3P54709 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP1B3P54709 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ATP1B3P54709 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP1B3P54709 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP1B3P54709 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP1B3P54709 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP1B3P54709 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP1B3P54709 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP1B3P54709 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP1B3P54709 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP1B3P54709 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP1B3P54709 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP1B3P54709 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP1B3P54709 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP1B3P54709 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP1B3P54709 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP1B3P54709 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP1B3P54709 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP1B3P54709 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP1B3P54709 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP1B3P54709 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP1B3P54709 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP1B3P54709 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP1B3P54709 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP1B3P54709 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP1B3P54709 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP1B3P54709 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP1B3P54709 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP1B3P54709 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
ATP1B3P54709 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP1B3P54709 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP1B3P54709 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP1B3P54709 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP1B3P54709 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP1B3P54709 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP1B3P54709 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP1B3P54709 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP1B3P54709 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP1B3P54709 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP1B3P54709 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP1B3P54709 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP1B3P54709 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP1B3P54709 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP1B3P54709 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP1B3P54709 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP1B3P54709 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP1B3P54709 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP1B3P54709 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP1B3P54709 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP1B3P54709 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP1B3P54709 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms