Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP12AP54707 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP12AP54707 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP12AP54707 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP12AP54707 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP12AP54707 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP12AP54707 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP12AP54707 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP12AP54707 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP12AP54707 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP12AP54707 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP12AP54707 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP12AP54707 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP12AP54707 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP12AP54707 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP12AP54707 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP12AP54707 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP12AP54707 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP12AP54707 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP12AP54707 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP12AP54707 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP12AP54707 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP12AP54707 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP12AP54707 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP12AP54707 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP12AP54707 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP12AP54707 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP12AP54707 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP12AP54707 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP12AP54707 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP12AP54707 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP12AP54707 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP12AP54707 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP12AP54707 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP12AP54707 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP12AP54707 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP12AP54707 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP12AP54707 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP12AP54707 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP12AP54707 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP12AP54707 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP12AP54707 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP12AP54707 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP12AP54707 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP12AP54707 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP12AP54707 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP12AP54707 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP12AP54707 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP12AP54707 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP12AP54707 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP12AP54707 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP12AP54707 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP12AP54707 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP12AP54707 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP12AP54707 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP12AP54707 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP12AP54707 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP12AP54707 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP12AP54707 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP12AP54707 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP12AP54707 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP12AP54707 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP12AP54707 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP12AP54707 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP12AP54707 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP12AP54707 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP12AP54707 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP12AP54707 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP12AP54707 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP12AP54707 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP12AP54707 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP12AP54707 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP12AP54707 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP12AP54707 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP12AP54707 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP12AP54707 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP12AP54707 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP12AP54707 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP12AP54707 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP12AP54707 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP12AP54707 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP12AP54707 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP12AP54707 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP12AP54707 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP12AP54707 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP12AP54707 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP12AP54707 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP12AP54707 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP12AP54707 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP12AP54707 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATP12AP54707 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATP12AP54707 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP12AP54707 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP12AP54707 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP12AP54707 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP12AP54707 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP12AP54707 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP12AP54707 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP12AP54707 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP12AP54707 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms