Protein–RNA interactions for Protein: P54278

PMS2, Mismatch repair endonuclease PMS2, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P54278 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PMS2P54278 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PMS2P54278 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PMS2P54278 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PMS2P54278 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PMS2P54278 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PMS2P54278 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PMS2P54278 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PMS2P54278 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PMS2P54278 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PMS2P54278 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PMS2P54278 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PMS2P54278 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PMS2P54278 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PMS2P54278 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PMS2P54278 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PMS2P54278 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PMS2P54278 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PMS2P54278 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PMS2P54278 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PMS2P54278 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PMS2P54278 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PMS2P54278 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PMS2P54278 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PMS2P54278 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PMS2P54278 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PMS2P54278 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PMS2P54278 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PMS2P54278 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PMS2P54278 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PMS2P54278 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PMS2P54278 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PMS2P54278 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PMS2P54278 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PMS2P54278 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PMS2P54278 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PMS2P54278 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PMS2P54278 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PMS2P54278 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PMS2P54278 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PMS2P54278 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PMS2P54278 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PMS2P54278 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PMS2P54278 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PMS2P54278 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PMS2P54278 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PMS2P54278 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PMS2P54278 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PMS2P54278 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PMS2P54278 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PMS2P54278 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PMS2P54278 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PMS2P54278 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PMS2P54278 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PMS2P54278 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PMS2P54278 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PMS2P54278 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PMS2P54278 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PMS2P54278 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PMS2P54278 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PMS2P54278 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PMS2P54278 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PMS2P54278 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PMS2P54278 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PMS2P54278 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PMS2P54278 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PMS2P54278 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PMS2P54278 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PMS2P54278 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PMS2P54278 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PMS2P54278 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PMS2P54278 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PMS2P54278 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PMS2P54278 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PMS2P54278 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PMS2P54278 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PMS2P54278 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PMS2P54278 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PMS2P54278 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PMS2P54278 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PMS2P54278 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PMS2P54278 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PMS2P54278 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PMS2P54278 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PMS2P54278 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PMS2P54278 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PMS2P54278 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PMS2P54278 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PMS2P54278 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PMS2P54278 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PMS2P54278 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PMS2P54278 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PMS2P54278 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PMS2P54278 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PMS2P54278 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PMS2P54278 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PMS2P54278 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PMS2P54278 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PMS2P54278 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PMS2P54278 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms