Protein–RNA interactions for Protein: P54219

SLC18A1, Chromaffin granule amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A1P54219 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC18A1P54219 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC18A1P54219 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC18A1P54219 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC18A1P54219 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC18A1P54219 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC18A1P54219 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC18A1P54219 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC18A1P54219 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC18A1P54219 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC18A1P54219 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC18A1P54219 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC18A1P54219 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC18A1P54219 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC18A1P54219 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC18A1P54219 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC18A1P54219 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC18A1P54219 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC18A1P54219 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC18A1P54219 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC18A1P54219 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC18A1P54219 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC18A1P54219 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC18A1P54219 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC18A1P54219 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC18A1P54219 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC18A1P54219 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC18A1P54219 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC18A1P54219 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC18A1P54219 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC18A1P54219 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC18A1P54219 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC18A1P54219 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC18A1P54219 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC18A1P54219 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC18A1P54219 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC18A1P54219 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC18A1P54219 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC18A1P54219 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC18A1P54219 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC18A1P54219 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC18A1P54219 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC18A1P54219 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC18A1P54219 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC18A1P54219 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC18A1P54219 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC18A1P54219 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC18A1P54219 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC18A1P54219 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC18A1P54219 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC18A1P54219 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC18A1P54219 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC18A1P54219 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC18A1P54219 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC18A1P54219 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC18A1P54219 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC18A1P54219 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC18A1P54219 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC18A1P54219 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC18A1P54219 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC18A1P54219 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC18A1P54219 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC18A1P54219 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC18A1P54219 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC18A1P54219 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC18A1P54219 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC18A1P54219 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC18A1P54219 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC18A1P54219 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC18A1P54219 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC18A1P54219 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC18A1P54219 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC18A1P54219 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC18A1P54219 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC18A1P54219 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC18A1P54219 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC18A1P54219 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC18A1P54219 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC18A1P54219 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC18A1P54219 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC18A1P54219 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC18A1P54219 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC18A1P54219 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC18A1P54219 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC18A1P54219 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC18A1P54219 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC18A1P54219 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC18A1P54219 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC18A1P54219 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC18A1P54219 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC18A1P54219 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC18A1P54219 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC18A1P54219 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC18A1P54219 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC18A1P54219 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC18A1P54219 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC18A1P54219 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC18A1P54219 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC18A1P54219 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC18A1P54219 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms