Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
NUP98P52948 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NUP98P52948 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
NUP98P52948 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
NUP98P52948 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NUP98P52948 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NUP98P52948 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
NUP98P52948 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NUP98P52948 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NUP98P52948 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NUP98P52948 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC32.32■■■□□ 2.77
NUP98P52948 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
NUP98P52948 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
NUP98P52948 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
NUP98P52948 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
NUP98P52948 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
NUP98P52948 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NUP98P52948 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
NUP98P52948 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
NUP98P52948 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NUP98P52948 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NUP98P52948 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
NUP98P52948 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NUP98P52948 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
NUP98P52948 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
NUP98P52948 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NUP98P52948 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
NUP98P52948 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
NUP98P52948 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
NUP98P52948 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
NUP98P52948 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
NUP98P52948 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
NUP98P52948 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
NUP98P52948 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
NUP98P52948 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NUP98P52948 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NUP98P52948 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NUP98P52948 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NUP98P52948 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NUP98P52948 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NUP98P52948 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NUP98P52948 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NUP98P52948 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NUP98P52948 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
NUP98P52948 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
NUP98P52948 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
NUP98P52948 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
NUP98P52948 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
NUP98P52948 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
NUP98P52948 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NUP98P52948 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NUP98P52948 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NUP98P52948 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NUP98P52948 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NUP98P52948 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NUP98P52948 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NUP98P52948 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NUP98P52948 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NUP98P52948 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
NUP98P52948 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
NUP98P52948 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NUP98P52948 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NUP98P52948 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NUP98P52948 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NUP98P52948 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NUP98P52948 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NUP98P52948 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NUP98P52948 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NUP98P52948 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NUP98P52948 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NUP98P52948 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NUP98P52948 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NUP98P52948 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
NUP98P52948 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
NUP98P52948 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NUP98P52948 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NUP98P52948 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NUP98P52948 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NUP98P52948 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NUP98P52948 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
NUP98P52948 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
NUP98P52948 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
NUP98P52948 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NUP98P52948 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
NUP98P52948 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NUP98P52948 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
NUP98P52948 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
NUP98P52948 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
NUP98P52948 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
NUP98P52948 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
NUP98P52948 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NUP98P52948 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NUP98P52948 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
NUP98P52948 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
NUP98P52948 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NUP98P52948 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NUP98P52948 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NUP98P52948 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NUP98P52948 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
NUP98P52948 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms