Protein–RNA interactions for Protein: P51861

CDR1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR1P51861 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDR1P51861 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDR1P51861 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDR1P51861 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CDR1P51861 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDR1P51861 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDR1P51861 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDR1P51861 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDR1P51861 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDR1P51861 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDR1P51861 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDR1P51861 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CDR1P51861 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDR1P51861 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CDR1P51861 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDR1P51861 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDR1P51861 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDR1P51861 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDR1P51861 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDR1P51861 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDR1P51861 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDR1P51861 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDR1P51861 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDR1P51861 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDR1P51861 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDR1P51861 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDR1P51861 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDR1P51861 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDR1P51861 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDR1P51861 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDR1P51861 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDR1P51861 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDR1P51861 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDR1P51861 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDR1P51861 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDR1P51861 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDR1P51861 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDR1P51861 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDR1P51861 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDR1P51861 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDR1P51861 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDR1P51861 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDR1P51861 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDR1P51861 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDR1P51861 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDR1P51861 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDR1P51861 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDR1P51861 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDR1P51861 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDR1P51861 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDR1P51861 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDR1P51861 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDR1P51861 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDR1P51861 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDR1P51861 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDR1P51861 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDR1P51861 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDR1P51861 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDR1P51861 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDR1P51861 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDR1P51861 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDR1P51861 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDR1P51861 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDR1P51861 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDR1P51861 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDR1P51861 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDR1P51861 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDR1P51861 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CDR1P51861 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDR1P51861 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDR1P51861 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDR1P51861 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDR1P51861 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDR1P51861 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDR1P51861 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDR1P51861 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDR1P51861 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDR1P51861 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CDR1P51861 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDR1P51861 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDR1P51861 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CDR1P51861 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDR1P51861 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CDR1P51861 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDR1P51861 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDR1P51861 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDR1P51861 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDR1P51861 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDR1P51861 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CDR1P51861 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CDR1P51861 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CDR1P51861 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CDR1P51861 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CDR1P51861 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CDR1P51861 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDR1P51861 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDR1P51861 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDR1P51861 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDR1P51861 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDR1P51861 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms