Protein–RNA interactions for Protein: P51668

UBE2D1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D1P51668 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2D1P51668 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2D1P51668 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2D1P51668 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE2D1P51668 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE2D1P51668 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE2D1P51668 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE2D1P51668 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE2D1P51668 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE2D1P51668 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE2D1P51668 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE2D1P51668 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
UBE2D1P51668 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBE2D1P51668 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBE2D1P51668 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBE2D1P51668 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBE2D1P51668 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBE2D1P51668 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBE2D1P51668 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBE2D1P51668 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBE2D1P51668 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBE2D1P51668 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBE2D1P51668 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBE2D1P51668 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBE2D1P51668 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBE2D1P51668 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBE2D1P51668 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBE2D1P51668 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBE2D1P51668 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBE2D1P51668 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBE2D1P51668 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBE2D1P51668 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBE2D1P51668 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBE2D1P51668 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBE2D1P51668 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBE2D1P51668 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBE2D1P51668 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBE2D1P51668 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBE2D1P51668 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBE2D1P51668 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBE2D1P51668 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBE2D1P51668 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBE2D1P51668 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBE2D1P51668 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE2D1P51668 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE2D1P51668 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE2D1P51668 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE2D1P51668 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE2D1P51668 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE2D1P51668 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE2D1P51668 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE2D1P51668 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE2D1P51668 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE2D1P51668 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE2D1P51668 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE2D1P51668 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE2D1P51668 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE2D1P51668 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE2D1P51668 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE2D1P51668 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE2D1P51668 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE2D1P51668 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE2D1P51668 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE2D1P51668 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE2D1P51668 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE2D1P51668 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE2D1P51668 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE2D1P51668 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE2D1P51668 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE2D1P51668 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE2D1P51668 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE2D1P51668 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE2D1P51668 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE2D1P51668 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE2D1P51668 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE2D1P51668 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE2D1P51668 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE2D1P51668 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE2D1P51668 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE2D1P51668 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE2D1P51668 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE2D1P51668 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE2D1P51668 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE2D1P51668 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE2D1P51668 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE2D1P51668 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2D1P51668 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2D1P51668 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2D1P51668 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2D1P51668 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2D1P51668 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2D1P51668 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2D1P51668 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2D1P51668 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2D1P51668 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2D1P51668 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2D1P51668 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2D1P51668 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2D1P51668 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2D1P51668 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms