Protein–RNA interactions for Protein: P50750

CDK9, Cyclin-dependent kinase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK9P50750 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK9P50750 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK9P50750 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK9P50750 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK9P50750 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK9P50750 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK9P50750 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK9P50750 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK9P50750 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK9P50750 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK9P50750 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK9P50750 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK9P50750 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK9P50750 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK9P50750 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK9P50750 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK9P50750 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK9P50750 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK9P50750 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK9P50750 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK9P50750 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK9P50750 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK9P50750 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK9P50750 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK9P50750 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK9P50750 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK9P50750 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK9P50750 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK9P50750 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK9P50750 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK9P50750 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK9P50750 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK9P50750 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK9P50750 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK9P50750 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK9P50750 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK9P50750 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK9P50750 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDK9P50750 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDK9P50750 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDK9P50750 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDK9P50750 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDK9P50750 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK9P50750 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK9P50750 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK9P50750 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK9P50750 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK9P50750 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK9P50750 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK9P50750 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK9P50750 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK9P50750 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK9P50750 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK9P50750 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK9P50750 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK9P50750 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK9P50750 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK9P50750 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK9P50750 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK9P50750 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK9P50750 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK9P50750 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK9P50750 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK9P50750 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK9P50750 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK9P50750 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK9P50750 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK9P50750 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK9P50750 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK9P50750 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK9P50750 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK9P50750 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK9P50750 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK9P50750 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK9P50750 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK9P50750 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK9P50750 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK9P50750 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK9P50750 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK9P50750 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK9P50750 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK9P50750 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK9P50750 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK9P50750 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK9P50750 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK9P50750 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK9P50750 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK9P50750 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK9P50750 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK9P50750 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK9P50750 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK9P50750 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK9P50750 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK9P50750 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK9P50750 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK9P50750 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK9P50750 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK9P50750 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK9P50750 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK9P50750 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms