Protein–RNA interactions for Protein: P49798

RGS4, Regulator of G-protein signaling 4, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGS4P49798 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RGS4P49798 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGS4P49798 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RGS4P49798 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGS4P49798 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGS4P49798 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGS4P49798 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGS4P49798 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGS4P49798 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGS4P49798 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGS4P49798 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGS4P49798 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RGS4P49798 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGS4P49798 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGS4P49798 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGS4P49798 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGS4P49798 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGS4P49798 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGS4P49798 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGS4P49798 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RGS4P49798 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RGS4P49798 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RGS4P49798 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RGS4P49798 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RGS4P49798 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RGS4P49798 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RGS4P49798 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RGS4P49798 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RGS4P49798 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RGS4P49798 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RGS4P49798 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RGS4P49798 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RGS4P49798 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RGS4P49798 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RGS4P49798 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGS4P49798 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGS4P49798 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGS4P49798 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGS4P49798 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGS4P49798 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGS4P49798 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGS4P49798 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGS4P49798 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGS4P49798 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGS4P49798 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGS4P49798 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RGS4P49798 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RGS4P49798 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RGS4P49798 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGS4P49798 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGS4P49798 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGS4P49798 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGS4P49798 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGS4P49798 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGS4P49798 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGS4P49798 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGS4P49798 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGS4P49798 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGS4P49798 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGS4P49798 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RGS4P49798 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGS4P49798 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGS4P49798 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGS4P49798 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGS4P49798 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGS4P49798 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGS4P49798 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGS4P49798 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGS4P49798 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RGS4P49798 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGS4P49798 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGS4P49798 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGS4P49798 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGS4P49798 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGS4P49798 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RGS4P49798 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGS4P49798 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGS4P49798 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGS4P49798 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGS4P49798 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RGS4P49798 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGS4P49798 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RGS4P49798 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGS4P49798 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGS4P49798 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RGS4P49798 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RGS4P49798 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RGS4P49798 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RGS4P49798 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RGS4P49798 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RGS4P49798 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RGS4P49798 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGS4P49798 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGS4P49798 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGS4P49798 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGS4P49798 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGS4P49798 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGS4P49798 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGS4P49798 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGS4P49798 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms