Protein–RNA interactions for Protein: P48645

NMU, Neuromedin-U, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMUP48645 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NMUP48645 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NMUP48645 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NMUP48645 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NMUP48645 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NMUP48645 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NMUP48645 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NMUP48645 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NMUP48645 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NMUP48645 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NMUP48645 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMUP48645 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMUP48645 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMUP48645 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMUP48645 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMUP48645 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMUP48645 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMUP48645 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMUP48645 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMUP48645 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMUP48645 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NMUP48645 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NMUP48645 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NMUP48645 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NMUP48645 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NMUP48645 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NMUP48645 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NMUP48645 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NMUP48645 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NMUP48645 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NMUP48645 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMUP48645 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMUP48645 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMUP48645 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMUP48645 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMUP48645 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMUP48645 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMUP48645 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NMUP48645 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMUP48645 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMUP48645 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NMUP48645 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NMUP48645 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NMUP48645 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NMUP48645 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NMUP48645 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NMUP48645 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NMUP48645 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NMUP48645 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NMUP48645 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NMUP48645 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NMUP48645 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NMUP48645 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NMUP48645 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NMUP48645 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NMUP48645 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NMUP48645 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMUP48645 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMUP48645 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMUP48645 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMUP48645 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMUP48645 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMUP48645 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMUP48645 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMUP48645 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMUP48645 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMUP48645 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMUP48645 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMUP48645 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMUP48645 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NMUP48645 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NMUP48645 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMUP48645 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMUP48645 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMUP48645 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMUP48645 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMUP48645 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMUP48645 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMUP48645 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMUP48645 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMUP48645 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMUP48645 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMUP48645 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMUP48645 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMUP48645 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NMUP48645 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NMUP48645 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NMUP48645 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NMUP48645 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NMUP48645 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NMUP48645 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NMUP48645 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NMUP48645 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NMUP48645 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NMUP48645 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NMUP48645 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NMUP48645 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NMUP48645 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NMUP48645 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NMUP48645 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms