Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
XCR1P46094 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
XCR1P46094 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
XCR1P46094 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
XCR1P46094 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
XCR1P46094 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
XCR1P46094 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
XCR1P46094 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
XCR1P46094 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
XCR1P46094 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
XCR1P46094 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
XCR1P46094 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
XCR1P46094 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
XCR1P46094 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
XCR1P46094 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
XCR1P46094 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
XCR1P46094 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
XCR1P46094 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
XCR1P46094 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
XCR1P46094 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
XCR1P46094 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
XCR1P46094 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
XCR1P46094 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
XCR1P46094 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
XCR1P46094 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
XCR1P46094 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
XCR1P46094 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
XCR1P46094 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
XCR1P46094 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
XCR1P46094 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
XCR1P46094 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
XCR1P46094 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
XCR1P46094 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
XCR1P46094 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
XCR1P46094 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
XCR1P46094 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
XCR1P46094 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
XCR1P46094 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
XCR1P46094 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
XCR1P46094 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
XCR1P46094 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
XCR1P46094 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
XCR1P46094 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
XCR1P46094 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
XCR1P46094 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
XCR1P46094 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
XCR1P46094 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
XCR1P46094 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
XCR1P46094 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
XCR1P46094 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
XCR1P46094 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
XCR1P46094 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
XCR1P46094 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
XCR1P46094 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
XCR1P46094 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
XCR1P46094 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
XCR1P46094 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
XCR1P46094 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XCR1P46094 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
XCR1P46094 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XCR1P46094 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XCR1P46094 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
XCR1P46094 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
XCR1P46094 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
XCR1P46094 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
XCR1P46094 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
XCR1P46094 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
XCR1P46094 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
XCR1P46094 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
XCR1P46094 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
XCR1P46094 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
XCR1P46094 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
XCR1P46094 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
XCR1P46094 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
XCR1P46094 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
XCR1P46094 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
XCR1P46094 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
XCR1P46094 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
XCR1P46094 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
XCR1P46094 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
XCR1P46094 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
XCR1P46094 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XCR1P46094 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
XCR1P46094 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
XCR1P46094 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
XCR1P46094 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
XCR1P46094 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
XCR1P46094 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
XCR1P46094 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XCR1P46094 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XCR1P46094 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
XCR1P46094 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XCR1P46094 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XCR1P46094 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
XCR1P46094 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XCR1P46094 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
XCR1P46094 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
XCR1P46094 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
XCR1P46094 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
XCR1P46094 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.8 ms