Protein–RNA interactions for Protein: P43088

PTGFR, Prostaglandin F2-alpha receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRP43088 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
PTGFRP43088 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTGFRP43088 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTGFRP43088 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTGFRP43088 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTGFRP43088 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTGFRP43088 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTGFRP43088 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTGFRP43088 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTGFRP43088 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTGFRP43088 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PTGFRP43088 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTGFRP43088 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTGFRP43088 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTGFRP43088 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PTGFRP43088 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTGFRP43088 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTGFRP43088 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTGFRP43088 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTGFRP43088 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTGFRP43088 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTGFRP43088 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTGFRP43088 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTGFRP43088 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTGFRP43088 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTGFRP43088 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTGFRP43088 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTGFRP43088 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTGFRP43088 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTGFRP43088 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTGFRP43088 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTGFRP43088 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTGFRP43088 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTGFRP43088 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTGFRP43088 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTGFRP43088 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTGFRP43088 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTGFRP43088 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PTGFRP43088 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PTGFRP43088 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTGFRP43088 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTGFRP43088 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTGFRP43088 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTGFRP43088 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTGFRP43088 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTGFRP43088 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTGFRP43088 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTGFRP43088 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTGFRP43088 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTGFRP43088 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTGFRP43088 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTGFRP43088 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTGFRP43088 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTGFRP43088 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTGFRP43088 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTGFRP43088 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTGFRP43088 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTGFRP43088 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTGFRP43088 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTGFRP43088 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTGFRP43088 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTGFRP43088 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTGFRP43088 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTGFRP43088 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTGFRP43088 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTGFRP43088 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGFRP43088 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGFRP43088 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGFRP43088 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGFRP43088 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGFRP43088 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGFRP43088 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGFRP43088 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PTGFRP43088 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTGFRP43088 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTGFRP43088 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PTGFRP43088 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTGFRP43088 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTGFRP43088 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTGFRP43088 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGFRP43088 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGFRP43088 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGFRP43088 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGFRP43088 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGFRP43088 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGFRP43088 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGFRP43088 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGFRP43088 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGFRP43088 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGFRP43088 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGFRP43088 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGFRP43088 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGFRP43088 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGFRP43088 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGFRP43088 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGFRP43088 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PTGFRP43088 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTGFRP43088 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTGFRP43088 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PTGFRP43088 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms