Protein–RNA interactions for Protein: P41743

PRKCI, Protein kinase C iota type, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCIP41743 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRKCIP41743 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRKCIP41743 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRKCIP41743 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRKCIP41743 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRKCIP41743 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRKCIP41743 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRKCIP41743 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRKCIP41743 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRKCIP41743 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRKCIP41743 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRKCIP41743 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRKCIP41743 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRKCIP41743 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRKCIP41743 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PRKCIP41743 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRKCIP41743 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRKCIP41743 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRKCIP41743 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRKCIP41743 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRKCIP41743 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRKCIP41743 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRKCIP41743 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRKCIP41743 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRKCIP41743 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PRKCIP41743 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PRKCIP41743 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRKCIP41743 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRKCIP41743 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRKCIP41743 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRKCIP41743 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRKCIP41743 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRKCIP41743 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRKCIP41743 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PRKCIP41743 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKCIP41743 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKCIP41743 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKCIP41743 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKCIP41743 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRKCIP41743 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRKCIP41743 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRKCIP41743 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRKCIP41743 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRKCIP41743 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PRKCIP41743 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRKCIP41743 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRKCIP41743 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRKCIP41743 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRKCIP41743 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRKCIP41743 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRKCIP41743 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRKCIP41743 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRKCIP41743 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRKCIP41743 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRKCIP41743 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRKCIP41743 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRKCIP41743 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRKCIP41743 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRKCIP41743 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRKCIP41743 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRKCIP41743 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRKCIP41743 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRKCIP41743 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRKCIP41743 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRKCIP41743 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRKCIP41743 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRKCIP41743 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRKCIP41743 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRKCIP41743 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PRKCIP41743 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRKCIP41743 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRKCIP41743 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRKCIP41743 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRKCIP41743 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRKCIP41743 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRKCIP41743 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
PRKCIP41743 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PRKCIP41743 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRKCIP41743 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRKCIP41743 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRKCIP41743 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PRKCIP41743 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PRKCIP41743 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PRKCIP41743 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PRKCIP41743 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRKCIP41743 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRKCIP41743 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRKCIP41743 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRKCIP41743 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRKCIP41743 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRKCIP41743 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRKCIP41743 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRKCIP41743 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRKCIP41743 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRKCIP41743 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRKCIP41743 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PRKCIP41743 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRKCIP41743 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRKCIP41743 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PRKCIP41743 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms