Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARL1P40616 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARL1P40616 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARL1P40616 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARL1P40616 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ARL1P40616 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ARL1P40616 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARL1P40616 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ARL1P40616 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARL1P40616 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARL1P40616 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARL1P40616 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARL1P40616 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARL1P40616 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARL1P40616 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARL1P40616 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARL1P40616 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARL1P40616 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ARL1P40616 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARL1P40616 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARL1P40616 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARL1P40616 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARL1P40616 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARL1P40616 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARL1P40616 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARL1P40616 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ARL1P40616 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARL1P40616 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARL1P40616 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARL1P40616 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARL1P40616 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARL1P40616 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARL1P40616 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARL1P40616 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARL1P40616 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARL1P40616 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARL1P40616 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARL1P40616 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARL1P40616 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARL1P40616 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARL1P40616 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARL1P40616 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARL1P40616 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARL1P40616 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARL1P40616 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARL1P40616 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARL1P40616 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARL1P40616 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARL1P40616 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARL1P40616 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARL1P40616 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARL1P40616 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ARL1P40616 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARL1P40616 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARL1P40616 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARL1P40616 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARL1P40616 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARL1P40616 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARL1P40616 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ARL1P40616 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARL1P40616 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ARL1P40616 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARL1P40616 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARL1P40616 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARL1P40616 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARL1P40616 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ARL1P40616 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARL1P40616 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARL1P40616 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ARL1P40616 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARL1P40616 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARL1P40616 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARL1P40616 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ARL1P40616 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARL1P40616 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARL1P40616 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARL1P40616 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARL1P40616 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARL1P40616 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ARL1P40616 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARL1P40616 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ARL1P40616 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARL1P40616 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARL1P40616 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARL1P40616 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARL1P40616 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARL1P40616 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ARL1P40616 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ARL1P40616 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARL1P40616 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARL1P40616 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARL1P40616 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARL1P40616 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARL1P40616 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARL1P40616 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARL1P40616 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARL1P40616 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARL1P40616 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARL1P40616 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARL1P40616 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms