Protein–RNA interactions for Protein: P36955

SERPINF1, Pigment epithelium-derived factor, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINF1P36955 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERPINF1P36955 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERPINF1P36955 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SERPINF1P36955 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERPINF1P36955 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SERPINF1P36955 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SERPINF1P36955 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SERPINF1P36955 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SERPINF1P36955 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SERPINF1P36955 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERPINF1P36955 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERPINF1P36955 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERPINF1P36955 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERPINF1P36955 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERPINF1P36955 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERPINF1P36955 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERPINF1P36955 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERPINF1P36955 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SERPINF1P36955 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SERPINF1P36955 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SERPINF1P36955 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERPINF1P36955 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERPINF1P36955 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERPINF1P36955 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERPINF1P36955 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERPINF1P36955 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERPINF1P36955 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERPINF1P36955 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERPINF1P36955 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERPINF1P36955 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERPINF1P36955 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERPINF1P36955 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERPINF1P36955 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERPINF1P36955 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERPINF1P36955 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERPINF1P36955 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERPINF1P36955 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERPINF1P36955 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERPINF1P36955 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERPINF1P36955 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERPINF1P36955 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SERPINF1P36955 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERPINF1P36955 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SERPINF1P36955 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SERPINF1P36955 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SERPINF1P36955 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SERPINF1P36955 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SERPINF1P36955 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SERPINF1P36955 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SERPINF1P36955 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SERPINF1P36955 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SERPINF1P36955 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SERPINF1P36955 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SERPINF1P36955 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SERPINF1P36955 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SERPINF1P36955 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SERPINF1P36955 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SERPINF1P36955 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SERPINF1P36955 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SERPINF1P36955 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SERPINF1P36955 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SERPINF1P36955 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SERPINF1P36955 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SERPINF1P36955 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SERPINF1P36955 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SERPINF1P36955 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SERPINF1P36955 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SERPINF1P36955 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SERPINF1P36955 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SERPINF1P36955 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SERPINF1P36955 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SERPINF1P36955 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SERPINF1P36955 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SERPINF1P36955 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SERPINF1P36955 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SERPINF1P36955 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SERPINF1P36955 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERPINF1P36955 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERPINF1P36955 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SERPINF1P36955 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SERPINF1P36955 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SERPINF1P36955 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SERPINF1P36955 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SERPINF1P36955 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SERPINF1P36955 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SERPINF1P36955 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SERPINF1P36955 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SERPINF1P36955 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SERPINF1P36955 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SERPINF1P36955 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SERPINF1P36955 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SERPINF1P36955 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SERPINF1P36955 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SERPINF1P36955 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SERPINF1P36955 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SERPINF1P36955 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SERPINF1P36955 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SERPINF1P36955 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SERPINF1P36955 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SERPINF1P36955 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms