Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TGFBR1P36897 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TGFBR1P36897 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TGFBR1P36897 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TGFBR1P36897 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TGFBR1P36897 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TGFBR1P36897 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TGFBR1P36897 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TGFBR1P36897 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TGFBR1P36897 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TGFBR1P36897 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TGFBR1P36897 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TGFBR1P36897 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TGFBR1P36897 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TGFBR1P36897 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TGFBR1P36897 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TGFBR1P36897 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TGFBR1P36897 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TGFBR1P36897 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TGFBR1P36897 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TGFBR1P36897 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TGFBR1P36897 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TGFBR1P36897 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TGFBR1P36897 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
TGFBR1P36897 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TGFBR1P36897 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TGFBR1P36897 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TGFBR1P36897 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TGFBR1P36897 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TGFBR1P36897 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TGFBR1P36897 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TGFBR1P36897 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TGFBR1P36897 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TGFBR1P36897 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TGFBR1P36897 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TGFBR1P36897 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TGFBR1P36897 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TGFBR1P36897 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TGFBR1P36897 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TGFBR1P36897 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TGFBR1P36897 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TGFBR1P36897 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TGFBR1P36897 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TGFBR1P36897 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TGFBR1P36897 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TGFBR1P36897 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TGFBR1P36897 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TGFBR1P36897 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TGFBR1P36897 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TGFBR1P36897 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TGFBR1P36897 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TGFBR1P36897 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TGFBR1P36897 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TGFBR1P36897 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TGFBR1P36897 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TGFBR1P36897 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TGFBR1P36897 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TGFBR1P36897 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TGFBR1P36897 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TGFBR1P36897 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TGFBR1P36897 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TGFBR1P36897 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TGFBR1P36897 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TGFBR1P36897 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TGFBR1P36897 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TGFBR1P36897 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TGFBR1P36897 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TGFBR1P36897 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TGFBR1P36897 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TGFBR1P36897 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TGFBR1P36897 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TGFBR1P36897 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TGFBR1P36897 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TGFBR1P36897 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TGFBR1P36897 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TGFBR1P36897 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TGFBR1P36897 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TGFBR1P36897 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TGFBR1P36897 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TGFBR1P36897 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TGFBR1P36897 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TGFBR1P36897 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TGFBR1P36897 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TGFBR1P36897 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TGFBR1P36897 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TGFBR1P36897 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TGFBR1P36897 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TGFBR1P36897 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TGFBR1P36897 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TGFBR1P36897 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TGFBR1P36897 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TGFBR1P36897 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TGFBR1P36897 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TGFBR1P36897 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TGFBR1P36897 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TGFBR1P36897 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TGFBR1P36897 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TGFBR1P36897 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TGFBR1P36897 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TGFBR1P36897 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms