Protein–RNA interactions for Protein: P35558

PCK1, Phosphoenolpyruvate carboxykinase, cytosolic [GTP], humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK1P35558 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCK1P35558 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCK1P35558 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCK1P35558 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCK1P35558 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCK1P35558 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCK1P35558 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PCK1P35558 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCK1P35558 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCK1P35558 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCK1P35558 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCK1P35558 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PCK1P35558 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCK1P35558 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCK1P35558 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCK1P35558 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCK1P35558 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCK1P35558 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCK1P35558 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCK1P35558 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCK1P35558 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PCK1P35558 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCK1P35558 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCK1P35558 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCK1P35558 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCK1P35558 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCK1P35558 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCK1P35558 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCK1P35558 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCK1P35558 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCK1P35558 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCK1P35558 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCK1P35558 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCK1P35558 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCK1P35558 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCK1P35558 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCK1P35558 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PCK1P35558 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCK1P35558 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCK1P35558 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCK1P35558 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCK1P35558 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCK1P35558 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCK1P35558 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCK1P35558 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCK1P35558 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCK1P35558 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCK1P35558 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCK1P35558 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCK1P35558 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCK1P35558 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCK1P35558 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCK1P35558 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PCK1P35558 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PCK1P35558 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PCK1P35558 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PCK1P35558 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCK1P35558 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCK1P35558 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCK1P35558 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCK1P35558 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCK1P35558 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PCK1P35558 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCK1P35558 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCK1P35558 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCK1P35558 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCK1P35558 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCK1P35558 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCK1P35558 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCK1P35558 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCK1P35558 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCK1P35558 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PCK1P35558 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PCK1P35558 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PCK1P35558 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PCK1P35558 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCK1P35558 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCK1P35558 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PCK1P35558 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PCK1P35558 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PCK1P35558 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PCK1P35558 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PCK1P35558 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PCK1P35558 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PCK1P35558 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PCK1P35558 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PCK1P35558 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PCK1P35558 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PCK1P35558 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PCK1P35558 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PCK1P35558 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PCK1P35558 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PCK1P35558 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PCK1P35558 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PCK1P35558 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PCK1P35558 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PCK1P35558 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PCK1P35558 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PCK1P35558 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PCK1P35558 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.5 ms