Protein–RNA interactions for Protein: P33240

CSTF2, Cleavage stimulation factor subunit 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF2P33240 PPARG-214ENST00000497594 1600 ntTSL 1 (best)9.28□□□□□ -0.922e-6■■■■■ 30.1
CSTF2P33240 PPARG-207ENST00000397015 1722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.062e-6■■■■■ 30.1
CSTF2P33240 PPARG-209ENST00000397026 2029 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.092e-6■■■■■ 30.1
CSTF2P33240 PPARG-204ENST00000397000 1122 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.392e-6■■■■■ 30.1
CSTF2P33240 PPARG-211ENST00000438682 560 ntTSL 34.93□□□□□ -1.622e-6■■■■■ 30.1
CSTF2P33240 RCC1-210ENST00000434290 1070 ntTSL 512.88□□□□□ -0.351e-6■■■■■ 30.1
CSTF2P33240 RCC1-207ENST00000427469 903 ntTSL 512.84□□□□□ -0.351e-6■■■■■ 30.1
CSTF2P33240 RCC1-204ENST00000398958 2715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71e-6■■■■■ 30.1
CSTF2P33240 RCC1-203ENST00000373833 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.851e-6■■■■■ 30.1
CSTF2P33240 SPATS2L-225ENST00000471533 329 ntTSL 319.3■□□□□ 0.685e-7■■■■■ 30.1
CSTF2P33240 SPATS2L-221ENST00000459656 1901 ntTSL 1 (best)19.19■□□□□ 0.665e-7■■■■■ 30.1
CSTF2P33240 SPATS2L-216ENST00000444012 605 ntTSL 418.31■□□□□ 0.525e-7■■■■■ 30.1
CSTF2P33240 SPATS2L-212ENST00000428692 541 ntTSL 417.89■□□□□ 0.455e-7■■■■■ 30.1
CSTF2P33240 SPATS2L-220ENST00000457757 835 ntTSL 517.89■□□□□ 0.455e-7■■■■■ 30.1
CSTF2P33240 SPATS2L-211ENST00000423749 771 ntTSL 517.65■□□□□ 0.425e-7■■■■■ 30.1
CSTF2P33240 SPATS2L-226ENST00000471601 1730 ntTSL 213.84□□□□□ -0.195e-7■■■■■ 30.1
CSTF2P33240 SPATS2L-214ENST00000439084 584 ntTSL 313.74□□□□□ -0.215e-7■■■■■ 30.1
CSTF2P33240 SPATS2L-219ENST00000453663 637 ntTSL 410.03□□□□□ -0.85e-7■■■■■ 30.1
CSTF2P33240 SPATS2L-215ENST00000439395 561 ntTSL 45.23□□□□□ -1.575e-7■■■■■ 30.1
CSTF2P33240 N4BP2L1-206ENST00000464470 1145 ntTSL 215.49■□□□□ 0.077e-11■■■■■ 30
CSTF2P33240 EEF1A1-201ENST00000309268 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.697e-11■■■■■ 30
CSTF2P33240 EEF1A1-208ENST00000491404 633 ntTSL 34.55□□□□□ -1.687e-11■■■■■ 30
CSTF2P33240 ARHGAP12-203ENST00000375245 4958 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.55e-10■■■■■ 30
CSTF2P33240 ARHGAP12-205ENST00000396144 5084 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.575e-10■■■■■ 30
CSTF2P33240 ARHGAP12-202ENST00000344936 4128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.765e-10■■■■■ 30
CSTF2P33240 ARHGAP12-204ENST00000375250 4914 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.35e-10■■■■■ 30
CSTF2P33240 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.885e-10■■■■■ 30
CSTF2P33240 FOXN3-211ENST00000555855 851 ntTSL 519.44■□□□□ 0.71e-8■■■■■ 30
CSTF2P33240 AL137230.2-201ENST00000555070 452 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.051e-8■■■■■ 30
CSTF2P33240 PDE3B-205ENST00000534317 5521 ntTSL 1 (best)18.25■□□□□ 0.512e-7■■■■■ 29.9
CSTF2P33240 SMAD5-208ENST00000513418 523 ntTSL 52.54□□□□□ -24e-10■■■■■ 29.9
CSTF2P33240 AIG1-204ENST00000367601 727 ntTSL 512.52□□□□□ -0.416e-13■■■■■ 29.9
CSTF2P33240 AIG1-205ENST00000447498 444 ntTSL 511.97□□□□□ -0.496e-13■■■■■ 29.9
CSTF2P33240 AIG1-202ENST00000357847 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.916e-13■■■■■ 29.9
CSTF2P33240 AIG1-201ENST00000275235 1202 ntTSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.056e-13■■■■■ 29.9
CSTF2P33240 AIG1-209ENST00000629020 3636 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.256e-13■■■■■ 29.9
CSTF2P33240 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.516e-13■■■■■ 29.9
CSTF2P33240 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.014e-10■■■■■ 29.9
CSTF2P33240 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.567e-9■■■■■ 29.8
CSTF2P33240 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.017e-9■■■■■ 29.8
CSTF2P33240 AC006504.5-209ENST00000591549 500 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.747e-9■■■■■ 29.8
CSTF2P33240 AC006504.5-206ENST00000585917 719 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.87e-9■■■■■ 29.8
CSTF2P33240 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.547e-9■■■■■ 29.8
CSTF2P33240 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.547e-9■■■■■ 29.8
CSTF2P33240 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.597e-9■■■■■ 29.8
CSTF2P33240 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.67e-9■■■■■ 29.8
CSTF2P33240 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.067e-9■■■■■ 29.8
CSTF2P33240 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.256e-11■■■■■ 29.8
CSTF2P33240 CNST-204ENST00000483271 2767 ntTSL 215.23■□□□□ 0.036e-11■■■■■ 29.8
CSTF2P33240 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.036e-11■■■■■ 29.8
CSTF2P33240 CNST-201ENST00000366511 645 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.916e-11■■■■■ 29.8
CSTF2P33240 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.78e-7■■■■■ 29.8
CSTF2P33240 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.268e-7■■■■■ 29.8
CSTF2P33240 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.018e-7■■■■■ 29.8
CSTF2P33240 CSNK1E-208ENST00000431611 814 ntTSL 515.06■□□□□ 08e-7■■■■■ 29.8
CSTF2P33240 CSNK1E-209ENST00000431632 763 ntTSL 213.92□□□□□ -0.188e-7■■■■■ 29.8
CSTF2P33240 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.368e-7■■■■■ 29.8
CSTF2P33240 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.024e-7■■■■■ 29.7
CSTF2P33240 TJP2-206ENST00000453658 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.384e-7■■■■■ 29.7
CSTF2P33240 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.28e-7■■■■■ 29.7
CSTF2P33240 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.248e-7■■■■■ 29.7
CSTF2P33240 PCM1-212ENST00000519253 6443 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.098e-7■■■■■ 29.7
CSTF2P33240 PCM1-215ENST00000522275 2379 ntTSL 24.89□□□□□ -1.638e-7■■■■■ 29.7
CSTF2P33240 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -28e-7■■■■■ 29.7
CSTF2P33240 PMM2-214ENST00000567697 5409 ntTSL 1 (best)11.86□□□□□ -0.512e-10■■■■■ 29.7
CSTF2P33240 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.33e-10■■■■■ 29.7
CSTF2P33240 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.733e-10■■■■■ 29.7
CSTF2P33240 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.285e-9■■■■■ 29.7
CSTF2P33240 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.375e-9■■■■■ 29.7
CSTF2P33240 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.415e-9■■■■■ 29.7
CSTF2P33240 GMDS-AS1-216ENST00000607519 579 ntTSL 410.06□□□□□ -0.81e-7■■■■■ 29.6
CSTF2P33240 PDCD2-201ENST00000167218 1118 ntTSL 527.54■■■□□ 23e-10■■■■■ 29.5
CSTF2P33240 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.733e-10■■■■■ 29.5
CSTF2P33240 PDCD2-214ENST00000545869 900 ntTSL 523.32■■□□□ 1.323e-10■■■■■ 29.5
CSTF2P33240 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.673e-10■■■■■ 29.5
CSTF2P33240 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.613e-10■■■■■ 29.5
CSTF2P33240 PDCD2-207ENST00000539212 445 ntTSL 317.1■□□□□ 0.333e-10■■■■■ 29.5
CSTF2P33240 PDCD2-213ENST00000544866 710 ntTSL 516.32■□□□□ 0.23e-10■■■■■ 29.5
CSTF2P33240 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.153e-10■■■■■ 29.5
CSTF2P33240 PDCD2-206ENST00000538195 560 ntTSL 56.07□□□□□ -1.443e-10■■■■■ 29.5
CSTF2P33240 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.91e-6■■■■■ 29.5
CSTF2P33240 SPAG9-211ENST00000511312 943 ntTSL 213.94□□□□□ -0.187e-7■■■■■ 29.5
CSTF2P33240 PLCB1-226ENST00000636784 100 ntTSL 53.36□□□□□ -1.879e-7■■■■■ 29.4
CSTF2P33240 KIAA1958-201ENST00000337530 11775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.992e-6■■■■■ 29.4
CSTF2P33240 KIAA1958-203ENST00000536272 7650 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.252e-6■■■■■ 29.4
CSTF2P33240 AL136531.2-201ENST00000618770 1164 ntTSL 218.05■□□□□ 0.481e-10■■■■■ 29.4
CSTF2P33240 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.11e-10■■■■■ 29.4
CSTF2P33240 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.181e-10■■■■■ 29.4
CSTF2P33240 OSER1-202ENST00000372970 1616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.091e-10■■■■■ 29.4
CSTF2P33240 TBCK-220ENST00000515705 592 ntTSL 58.87□□□□□ -0.994e-10■■■■■ 29.4
CSTF2P33240 TBCK-219ENST00000514689 703 ntTSL 35□□□□□ -1.614e-10■■■■■ 29.4
CSTF2P33240 IWS1-201ENST00000295321 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.383e-10■■■■■ 29.4
CSTF2P33240 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.286e-7■■■■■ 29.4
CSTF2P33240 TM2D1-211ENST00000496465 577 ntTSL 217.97■□□□□ 0.472e-8■■■■■ 29.3
CSTF2P33240 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.32e-8■■■■■ 29.3
CSTF2P33240 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.32e-8■■■■■ 29.3
CSTF2P33240 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.32e-8■■■■■ 29.3
CSTF2P33240 TM2D1-208ENST00000488206 921 ntTSL 515.07■□□□□ 02e-8■■■■■ 29.3
CSTF2P33240 TM2D1-203ENST00000371178 1056 ntTSL 513.97□□□□□ -0.172e-8■■■■■ 29.3
CSTF2P33240 TM2D1-210ENST00000494926 544 ntTSL 511.4□□□□□ -0.582e-8■■■■■ 29.3
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