RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496465.1

TM2D1-211, Transcript of TM2 domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene TM2D1, Length 577 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D1-211ENST00000496465 NISCHQ9Y2I1 1504 aa45.29■■■■■ 4.84
TM2D1-211ENST00000496465 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa40.56■■■■■ 4.08
TM2D1-211ENST00000496465 ABCC9O60706 1549 aa40.12■■■■■ 4.01
TM2D1-211ENST00000496465 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.4■■■■□ 3.74
TM2D1-211ENST00000496465 NACADO15069 1562 aa38.23■■■■□ 3.71
TM2D1-211ENST00000496465 DCAF8L2P0C7V8 631 aa37.96■■■■□ 3.67
TM2D1-211ENST00000496465 MYO15BQ96JP2 1530 aa37.86■■■■□ 3.65
TM2D1-211ENST00000496465 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.61■■■■□ 3.61
TM2D1-211ENST00000496465 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP37.6■■■■□ 3.61
TM2D1-211ENST00000496465 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa37.48■■■■□ 3.59
TM2D1-211ENST00000496465 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP37.37■■■■□ 3.57
TM2D1-211ENST00000496465 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.35■■■■□ 3.57
TM2D1-211ENST00000496465 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.29■■■■□ 3.56
TM2D1-211ENST00000496465 SCRIBQ14160 1630 aa36.89■■■■□ 3.5
TM2D1-211ENST00000496465 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa36.85■■■■□ 3.49
TM2D1-211ENST00000496465 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.32■■■■□ 3.41
TM2D1-211ENST00000496465 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.32■■■■□ 3.4
TM2D1-211ENST00000496465 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.12■■■■□ 3.37
TM2D1-211ENST00000496465 NCAPD3P42695 1498 aa35.29■■■■□ 3.24
TM2D1-211ENST00000496465 SMARCA4P51532 1647 aa35.28■■■■□ 3.24
TM2D1-211ENST00000496465 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.2■■■■□ 3.23
TM2D1-211ENST00000496465 SMARCA2P51531 1590 aa35.14■■■■□ 3.22
TM2D1-211ENST00000496465 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.14■■■■□ 3.22
TM2D1-211ENST00000496465 HMGXB3Q12766 1538 aa35.06■■■■□ 3.2
TM2D1-211ENST00000496465 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.97■■■■□ 3.19
TM2D1-211ENST00000496465 MROH2BQ7Z745 1585 aa34.88■■■■□ 3.17
TM2D1-211ENST00000496465 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP34.86■■■■□ 3.17
TM2D1-211ENST00000496465 ERCC6Q03468 1493 aa34.61■■■■□ 3.13
TM2D1-211ENST00000496465 NESP48681 1621 aa34.57■■■■□ 3.12
TM2D1-211ENST00000496465 WIZO95785 1651 aa34.5■■■■□ 3.11
TM2D1-211ENST00000496465 CUX2O14529 1486 aa34.5■■■■□ 3.11
TM2D1-211ENST00000496465 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.45■■■■□ 3.1
TM2D1-211ENST00000496465 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.28■■■■□ 3.08
TM2D1-211ENST00000496465 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.21■■■■□ 3.07
TM2D1-211ENST00000496465 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.21■■■■□ 3.07
TM2D1-211ENST00000496465 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.2■■■■□ 3.07
TM2D1-211ENST00000496465 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.2■■■■□ 3.06
TM2D1-211ENST00000496465 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34.09■■■■□ 3.05
TM2D1-211ENST00000496465 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa34.08■■■■□ 3.05
TM2D1-211ENST00000496465 CFTRP13569 1480 aa33.89■■■■□ 3.02
TM2D1-211ENST00000496465 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.88■■■■□ 3.01
TM2D1-211ENST00000496465 WDR62O43379 1518 aa33.82■■■■□ 3
TM2D1-211ENST00000496465 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.81■■■■□ 3
TM2D1-211ENST00000496465 FANCD2Q9BXW9 1451 aa33.8■■■■□ 3
TM2D1-211ENST00000496465 CCDC88BA6NC98 1476 aa33.69■■■□□ 2.98
TM2D1-211ENST00000496465 PRDM2Q13029 1718 aa33.68■■■□□ 2.98
TM2D1-211ENST00000496465 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33.51■■■□□ 2.95
TM2D1-211ENST00000496465 TOPBP1Q92547 1522 aa33.21■■■□□ 2.91
TM2D1-211ENST00000496465 ABCC8Q09428 1581 aa33.19■■■□□ 2.9
TM2D1-211ENST00000496465 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.13■■■□□ 2.89
TM2D1-211ENST00000496465 IFT140Q96RY7 1462 aa33.13■■■□□ 2.89
TM2D1-211ENST00000496465 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.02■■■□□ 2.88
TM2D1-211ENST00000496465 OSCARQ8IYS5 282 aa32.94■■■□□ 2.86
TM2D1-211ENST00000496465 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP32.93■■■□□ 2.86
TM2D1-211ENST00000496465 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.92■■■□□ 2.86
TM2D1-211ENST00000496465 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP32.9■■■□□ 2.86
TM2D1-211ENST00000496465 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP32.89■■■□□ 2.86
TM2D1-211ENST00000496465 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP32.76■■■□□ 2.84
TM2D1-211ENST00000496465 CUX1P39880 1505 aa32.76■■■□□ 2.83
TM2D1-211ENST00000496465 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa32.74■■■□□ 2.83
TM2D1-211ENST00000496465 SOGA1O94964 1423 aa32.73■■■□□ 2.83
TM2D1-211ENST00000496465 FGD5Q6ZNL6 1462 aa32.72■■■□□ 2.83
TM2D1-211ENST00000496465 WDR97A6NE52 1622 aa32.65■■■□□ 2.82
TM2D1-211ENST00000496465 TRIM41Q8WV44 630 aa32.63■■■□□ 2.81
TM2D1-211ENST00000496465 CHD1O14646 1710 aa32.62■■■□□ 2.81
TM2D1-211ENST00000496465 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP32.6■■■□□ 2.81
TM2D1-211ENST00000496465 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa32.51■■■□□ 2.8
TM2D1-211ENST00000496465 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa32.51■■■□□ 2.8
TM2D1-211ENST00000496465 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa32.51■■■□□ 2.8
TM2D1-211ENST00000496465 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.44■■■□□ 2.78
TM2D1-211ENST00000496465 ARHGEF11O15085 1522 aa32.43■■■□□ 2.78
TM2D1-211ENST00000496465 FBLN2P98095 1184 aa32.43■■■□□ 2.78
TM2D1-211ENST00000496465 GRIN2BQ13224 1484 aa32.42■■■□□ 2.78
TM2D1-211ENST00000496465 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.41■■■□□ 2.78
TM2D1-211ENST00000496465 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.4■■■□□ 2.78
TM2D1-211ENST00000496465 PBRM1Q86U86 1689 aa32.37■■■□□ 2.77
TM2D1-211ENST00000496465 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.37■■■□□ 2.77
TM2D1-211ENST00000496465 TOP2BQ02880 1626 aa32.36■■■□□ 2.77
TM2D1-211ENST00000496465 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.35■■■□□ 2.77
TM2D1-211ENST00000496465 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.34■■■□□ 2.77
TM2D1-211ENST00000496465 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP32.32■■■□□ 2.76
TM2D1-211ENST00000496465 SYNJ1O43426 1573 aa32.3■■■□□ 2.76
TM2D1-211ENST00000496465 SYNJ2O15056 1496 aa32.29■■■□□ 2.76
TM2D1-211ENST00000496465 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP32.28■■■□□ 2.76
TM2D1-211ENST00000496465 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.23■■■□□ 2.75
TM2D1-211ENST00000496465 ARAP1Q96P48 1450 aa32.12■■■□□ 2.73
TM2D1-211ENST00000496465 CYB5RLQ6IPT4 315 aa32.12■■■□□ 2.73
TM2D1-211ENST00000496465 ADAMTS12P58397 1594 aa32.05■■■□□ 2.72
TM2D1-211ENST00000496465 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.01■■■□□ 2.72
TM2D1-211ENST00000496465 GRIN2AQ12879 1464 aa32.01■■■□□ 2.71
TM2D1-211ENST00000496465 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.96■■■□□ 2.71
TM2D1-211ENST00000496465 NUP160Q12769 1436 aa31.9■■■□□ 2.7
TM2D1-211ENST00000496465 CEP170Q5SW79 1584 aa31.89■■■□□ 2.7
TM2D1-211ENST00000496465 SHROOM2Q13796 1616 aa31.77■■■□□ 2.68
TM2D1-211ENST00000496465 ERCC6L2Q5T890 1561 aa31.73■■■□□ 2.67
TM2D1-211ENST00000496465 KIF27Q86VH2 1401 aa31.68■■■□□ 2.66
TM2D1-211ENST00000496465 IGF1RP08069 1367 aa31.65■■■□□ 2.66
TM2D1-211ENST00000496465 TRHP20396 242 aaPredicted RBP31.63■■■□□ 2.65
TM2D1-211ENST00000496465 CUL7Q14999 1698 aa31.63■■■□□ 2.65
TM2D1-211ENST00000496465 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa31.59■■■□□ 2.65
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