Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSPOP30536 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSPOP30536 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSPOP30536 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TSPOP30536 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TSPOP30536 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TSPOP30536 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TSPOP30536 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TSPOP30536 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TSPOP30536 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TSPOP30536 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TSPOP30536 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TSPOP30536 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TSPOP30536 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TSPOP30536 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TSPOP30536 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TSPOP30536 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TSPOP30536 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSPOP30536 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSPOP30536 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSPOP30536 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSPOP30536 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSPOP30536 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSPOP30536 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSPOP30536 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TSPOP30536 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TSPOP30536 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TSPOP30536 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TSPOP30536 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TSPOP30536 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSPOP30536 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSPOP30536 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSPOP30536 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSPOP30536 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSPOP30536 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TSPOP30536 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSPOP30536 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSPOP30536 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSPOP30536 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSPOP30536 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSPOP30536 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSPOP30536 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSPOP30536 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSPOP30536 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSPOP30536 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TSPOP30536 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TSPOP30536 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TSPOP30536 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TSPOP30536 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TSPOP30536 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TSPOP30536 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TSPOP30536 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TSPOP30536 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TSPOP30536 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TSPOP30536 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TSPOP30536 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TSPOP30536 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TSPOP30536 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TSPOP30536 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TSPOP30536 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TSPOP30536 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TSPOP30536 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TSPOP30536 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TSPOP30536 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TSPOP30536 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TSPOP30536 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TSPOP30536 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TSPOP30536 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TSPOP30536 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TSPOP30536 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TSPOP30536 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TSPOP30536 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TSPOP30536 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TSPOP30536 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TSPOP30536 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TSPOP30536 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TSPOP30536 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TSPOP30536 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TSPOP30536 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TSPOP30536 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TSPOP30536 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TSPOP30536 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TSPOP30536 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TSPOP30536 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TSPOP30536 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TSPOP30536 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSPOP30536 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSPOP30536 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSPOP30536 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSPOP30536 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSPOP30536 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSPOP30536 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSPOP30536 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSPOP30536 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSPOP30536 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSPOP30536 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSPOP30536 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSPOP30536 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSPOP30536 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSPOP30536 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.2 ms