Protein–RNA interactions for Protein: P29122

PCSK6, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 6, humanhuman

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK6P29122 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCSK6P29122 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCSK6P29122 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCSK6P29122 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCSK6P29122 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCSK6P29122 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCSK6P29122 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCSK6P29122 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCSK6P29122 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCSK6P29122 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PCSK6P29122 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCSK6P29122 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCSK6P29122 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCSK6P29122 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCSK6P29122 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCSK6P29122 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCSK6P29122 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCSK6P29122 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCSK6P29122 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCSK6P29122 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCSK6P29122 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PCSK6P29122 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PCSK6P29122 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCSK6P29122 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCSK6P29122 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCSK6P29122 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCSK6P29122 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCSK6P29122 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCSK6P29122 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCSK6P29122 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCSK6P29122 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCSK6P29122 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCSK6P29122 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCSK6P29122 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCSK6P29122 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCSK6P29122 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCSK6P29122 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCSK6P29122 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCSK6P29122 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCSK6P29122 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCSK6P29122 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCSK6P29122 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PCSK6P29122 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCSK6P29122 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCSK6P29122 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCSK6P29122 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCSK6P29122 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCSK6P29122 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCSK6P29122 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCSK6P29122 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCSK6P29122 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCSK6P29122 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCSK6P29122 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCSK6P29122 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCSK6P29122 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCSK6P29122 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PCSK6P29122 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCSK6P29122 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCSK6P29122 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCSK6P29122 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCSK6P29122 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCSK6P29122 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCSK6P29122 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCSK6P29122 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCSK6P29122 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCSK6P29122 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCSK6P29122 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCSK6P29122 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCSK6P29122 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCSK6P29122 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCSK6P29122 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCSK6P29122 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCSK6P29122 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCSK6P29122 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCSK6P29122 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCSK6P29122 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCSK6P29122 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCSK6P29122 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCSK6P29122 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCSK6P29122 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCSK6P29122 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PCSK6P29122 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCSK6P29122 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCSK6P29122 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCSK6P29122 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCSK6P29122 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCSK6P29122 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCSK6P29122 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCSK6P29122 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCSK6P29122 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCSK6P29122 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCSK6P29122 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCSK6P29122 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCSK6P29122 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCSK6P29122 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCSK6P29122 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCSK6P29122 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCSK6P29122 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCSK6P29122 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCSK6P29122 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 275.5 ms