Protein–RNA interactions for Protein: P26045

PTPN3, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN3P26045 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPN3P26045 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PTPN3P26045 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PTPN3P26045 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PTPN3P26045 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPN3P26045 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPN3P26045 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPN3P26045 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPN3P26045 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPN3P26045 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPN3P26045 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPN3P26045 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPN3P26045 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPN3P26045 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPN3P26045 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPN3P26045 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPN3P26045 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPN3P26045 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPN3P26045 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPN3P26045 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPN3P26045 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPN3P26045 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPN3P26045 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPN3P26045 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPN3P26045 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPN3P26045 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPN3P26045 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPN3P26045 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPN3P26045 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPN3P26045 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPN3P26045 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPN3P26045 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPN3P26045 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPN3P26045 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPN3P26045 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPN3P26045 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTPN3P26045 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTPN3P26045 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTPN3P26045 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPN3P26045 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPN3P26045 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPN3P26045 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPN3P26045 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPN3P26045 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPN3P26045 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPN3P26045 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPN3P26045 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPN3P26045 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPN3P26045 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPN3P26045 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPN3P26045 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPN3P26045 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPN3P26045 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPN3P26045 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPN3P26045 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPN3P26045 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPN3P26045 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPN3P26045 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPN3P26045 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPN3P26045 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPN3P26045 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPN3P26045 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPN3P26045 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPN3P26045 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN3P26045 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN3P26045 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN3P26045 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN3P26045 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN3P26045 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPN3P26045 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPN3P26045 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPN3P26045 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPN3P26045 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPN3P26045 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPN3P26045 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPN3P26045 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPN3P26045 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPN3P26045 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPN3P26045 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPN3P26045 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPN3P26045 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPN3P26045 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPN3P26045 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPN3P26045 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPN3P26045 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPN3P26045 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPN3P26045 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPN3P26045 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPN3P26045 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPN3P26045 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN3P26045 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN3P26045 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN3P26045 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN3P26045 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN3P26045 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN3P26045 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPN3P26045 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPN3P26045 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPN3P26045 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPN3P26045 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms