Protein–RNA interactions for Protein: P24941

CDK2, Cyclin-dependent kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK2P24941 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK2P24941 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK2P24941 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK2P24941 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK2P24941 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK2P24941 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK2P24941 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK2P24941 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK2P24941 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK2P24941 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK2P24941 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK2P24941 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK2P24941 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK2P24941 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK2P24941 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK2P24941 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK2P24941 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK2P24941 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK2P24941 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK2P24941 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK2P24941 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK2P24941 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK2P24941 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK2P24941 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK2P24941 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK2P24941 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK2P24941 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK2P24941 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK2P24941 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK2P24941 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK2P24941 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK2P24941 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK2P24941 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK2P24941 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK2P24941 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK2P24941 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK2P24941 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK2P24941 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK2P24941 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK2P24941 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK2P24941 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK2P24941 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK2P24941 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK2P24941 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK2P24941 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK2P24941 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK2P24941 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK2P24941 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK2P24941 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK2P24941 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK2P24941 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK2P24941 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK2P24941 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK2P24941 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK2P24941 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK2P24941 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK2P24941 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK2P24941 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK2P24941 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK2P24941 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK2P24941 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK2P24941 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK2P24941 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK2P24941 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK2P24941 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK2P24941 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK2P24941 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK2P24941 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK2P24941 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK2P24941 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK2P24941 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK2P24941 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK2P24941 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK2P24941 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK2P24941 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK2P24941 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK2P24941 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK2P24941 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK2P24941 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK2P24941 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK2P24941 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK2P24941 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK2P24941 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK2P24941 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK2P24941 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK2P24941 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK2P24941 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK2P24941 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK2P24941 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK2P24941 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK2P24941 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK2P24941 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK2P24941 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK2P24941 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK2P24941 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK2P24941 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK2P24941 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK2P24941 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK2P24941 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK2P24941 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms