Protein–RNA interactions for Protein: P23368

ME2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME2P23368 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ME2P23368 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ME2P23368 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ME2P23368 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ME2P23368 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ME2P23368 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ME2P23368 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ME2P23368 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ME2P23368 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ME2P23368 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ME2P23368 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ME2P23368 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ME2P23368 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ME2P23368 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ME2P23368 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ME2P23368 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ME2P23368 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ME2P23368 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ME2P23368 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ME2P23368 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ME2P23368 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ME2P23368 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ME2P23368 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ME2P23368 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ME2P23368 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ME2P23368 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ME2P23368 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ME2P23368 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ME2P23368 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ME2P23368 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ME2P23368 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ME2P23368 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ME2P23368 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ME2P23368 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ME2P23368 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ME2P23368 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ME2P23368 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ME2P23368 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ME2P23368 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ME2P23368 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ME2P23368 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ME2P23368 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ME2P23368 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ME2P23368 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ME2P23368 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ME2P23368 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ME2P23368 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ME2P23368 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ME2P23368 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ME2P23368 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ME2P23368 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ME2P23368 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ME2P23368 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ME2P23368 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ME2P23368 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ME2P23368 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ME2P23368 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ME2P23368 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ME2P23368 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ME2P23368 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ME2P23368 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ME2P23368 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ME2P23368 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ME2P23368 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ME2P23368 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ME2P23368 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ME2P23368 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ME2P23368 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ME2P23368 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ME2P23368 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ME2P23368 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ME2P23368 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ME2P23368 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ME2P23368 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ME2P23368 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ME2P23368 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ME2P23368 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ME2P23368 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ME2P23368 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ME2P23368 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ME2P23368 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ME2P23368 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ME2P23368 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ME2P23368 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ME2P23368 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ME2P23368 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ME2P23368 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ME2P23368 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ME2P23368 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ME2P23368 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ME2P23368 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ME2P23368 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ME2P23368 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ME2P23368 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ME2P23368 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ME2P23368 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ME2P23368 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ME2P23368 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ME2P23368 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ME2P23368 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms