Protein–RNA interactions for Protein: P20807

CAPN3, Calpain-3, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3P20807 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN3P20807 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN3P20807 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN3P20807 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPN3P20807 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPN3P20807 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN3P20807 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN3P20807 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN3P20807 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN3P20807 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN3P20807 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN3P20807 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN3P20807 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN3P20807 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN3P20807 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN3P20807 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN3P20807 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPN3P20807 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPN3P20807 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPN3P20807 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPN3P20807 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN3P20807 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN3P20807 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN3P20807 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPN3P20807 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPN3P20807 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPN3P20807 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPN3P20807 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CAPN3P20807 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN3P20807 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN3P20807 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN3P20807 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN3P20807 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN3P20807 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN3P20807 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPN3P20807 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPN3P20807 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPN3P20807 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPN3P20807 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPN3P20807 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPN3P20807 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPN3P20807 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN3P20807 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN3P20807 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN3P20807 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN3P20807 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN3P20807 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN3P20807 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN3P20807 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN3P20807 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN3P20807 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN3P20807 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN3P20807 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN3P20807 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN3P20807 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN3P20807 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN3P20807 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN3P20807 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN3P20807 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN3P20807 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN3P20807 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN3P20807 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN3P20807 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN3P20807 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN3P20807 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN3P20807 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN3P20807 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPN3P20807 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN3P20807 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN3P20807 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN3P20807 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN3P20807 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN3P20807 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN3P20807 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN3P20807 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN3P20807 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN3P20807 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN3P20807 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPN3P20807 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPN3P20807 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN3P20807 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN3P20807 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN3P20807 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN3P20807 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN3P20807 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN3P20807 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN3P20807 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN3P20807 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN3P20807 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPN3P20807 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPN3P20807 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPN3P20807 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPN3P20807 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN3P20807 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN3P20807 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN3P20807 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN3P20807 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN3P20807 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN3P20807 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN3P20807 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms