Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NTF3P20783 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NTF3P20783 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NTF3P20783 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NTF3P20783 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NTF3P20783 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NTF3P20783 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NTF3P20783 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NTF3P20783 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NTF3P20783 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NTF3P20783 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NTF3P20783 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NTF3P20783 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NTF3P20783 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NTF3P20783 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NTF3P20783 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NTF3P20783 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NTF3P20783 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NTF3P20783 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NTF3P20783 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NTF3P20783 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NTF3P20783 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NTF3P20783 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NTF3P20783 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NTF3P20783 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NTF3P20783 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NTF3P20783 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NTF3P20783 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NTF3P20783 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NTF3P20783 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NTF3P20783 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NTF3P20783 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NTF3P20783 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NTF3P20783 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NTF3P20783 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NTF3P20783 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NTF3P20783 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
NTF3P20783 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NTF3P20783 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NTF3P20783 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NTF3P20783 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NTF3P20783 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NTF3P20783 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NTF3P20783 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NTF3P20783 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NTF3P20783 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NTF3P20783 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NTF3P20783 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NTF3P20783 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NTF3P20783 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NTF3P20783 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NTF3P20783 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NTF3P20783 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NTF3P20783 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NTF3P20783 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NTF3P20783 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NTF3P20783 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NTF3P20783 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NTF3P20783 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NTF3P20783 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NTF3P20783 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NTF3P20783 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NTF3P20783 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NTF3P20783 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NTF3P20783 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NTF3P20783 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NTF3P20783 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NTF3P20783 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NTF3P20783 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NTF3P20783 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NTF3P20783 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NTF3P20783 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NTF3P20783 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NTF3P20783 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NTF3P20783 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NTF3P20783 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NTF3P20783 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NTF3P20783 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NTF3P20783 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NTF3P20783 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NTF3P20783 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NTF3P20783 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NTF3P20783 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NTF3P20783 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NTF3P20783 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NTF3P20783 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NTF3P20783 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NTF3P20783 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NTF3P20783 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NTF3P20783 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NTF3P20783 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NTF3P20783 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NTF3P20783 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NTF3P20783 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NTF3P20783 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NTF3P20783 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NTF3P20783 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NTF3P20783 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NTF3P20783 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NTF3P20783 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.9 ms