Protein–RNA interactions for Protein: P20749

BCL3, B-cell lymphoma 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL3P20749 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
BCL3P20749 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BCL3P20749 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BCL3P20749 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BCL3P20749 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BCL3P20749 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BCL3P20749 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
BCL3P20749 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BCL3P20749 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BCL3P20749 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BCL3P20749 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BCL3P20749 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BCL3P20749 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
BCL3P20749 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BCL3P20749 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BCL3P20749 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BCL3P20749 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BCL3P20749 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BCL3P20749 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BCL3P20749 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BCL3P20749 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BCL3P20749 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BCL3P20749 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BCL3P20749 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCL3P20749 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCL3P20749 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCL3P20749 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCL3P20749 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCL3P20749 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCL3P20749 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCL3P20749 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCL3P20749 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BCL3P20749 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BCL3P20749 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BCL3P20749 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCL3P20749 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCL3P20749 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCL3P20749 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCL3P20749 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCL3P20749 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCL3P20749 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCL3P20749 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCL3P20749 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCL3P20749 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCL3P20749 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
BCL3P20749 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCL3P20749 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCL3P20749 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCL3P20749 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCL3P20749 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCL3P20749 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCL3P20749 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCL3P20749 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCL3P20749 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCL3P20749 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCL3P20749 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCL3P20749 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCL3P20749 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCL3P20749 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCL3P20749 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCL3P20749 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCL3P20749 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCL3P20749 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCL3P20749 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCL3P20749 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCL3P20749 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCL3P20749 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCL3P20749 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCL3P20749 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BCL3P20749 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BCL3P20749 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BCL3P20749 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BCL3P20749 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BCL3P20749 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BCL3P20749 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BCL3P20749 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BCL3P20749 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCL3P20749 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCL3P20749 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCL3P20749 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCL3P20749 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCL3P20749 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCL3P20749 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCL3P20749 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCL3P20749 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCL3P20749 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCL3P20749 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BCL3P20749 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BCL3P20749 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCL3P20749 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCL3P20749 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCL3P20749 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCL3P20749 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BCL3P20749 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCL3P20749 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCL3P20749 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCL3P20749 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCL3P20749 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCL3P20749 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCL3P20749 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms