Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB5AP20339 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB5AP20339 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RAB5AP20339 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RAB5AP20339 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB5AP20339 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB5AP20339 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB5AP20339 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB5AP20339 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB5AP20339 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB5AP20339 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB5AP20339 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB5AP20339 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB5AP20339 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB5AP20339 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB5AP20339 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB5AP20339 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB5AP20339 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB5AP20339 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB5AP20339 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAB5AP20339 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAB5AP20339 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAB5AP20339 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB5AP20339 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB5AP20339 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB5AP20339 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB5AP20339 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB5AP20339 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB5AP20339 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB5AP20339 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB5AP20339 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB5AP20339 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB5AP20339 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB5AP20339 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB5AP20339 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB5AP20339 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB5AP20339 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB5AP20339 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB5AP20339 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB5AP20339 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB5AP20339 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB5AP20339 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB5AP20339 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB5AP20339 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB5AP20339 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB5AP20339 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB5AP20339 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB5AP20339 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB5AP20339 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB5AP20339 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB5AP20339 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB5AP20339 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB5AP20339 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB5AP20339 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB5AP20339 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB5AP20339 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB5AP20339 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB5AP20339 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB5AP20339 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB5AP20339 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB5AP20339 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB5AP20339 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB5AP20339 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB5AP20339 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RAB5AP20339 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RAB5AP20339 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RAB5AP20339 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RAB5AP20339 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RAB5AP20339 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RAB5AP20339 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RAB5AP20339 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RAB5AP20339 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RAB5AP20339 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RAB5AP20339 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB5AP20339 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB5AP20339 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB5AP20339 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB5AP20339 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB5AP20339 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB5AP20339 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB5AP20339 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB5AP20339 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB5AP20339 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB5AP20339 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB5AP20339 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB5AP20339 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB5AP20339 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB5AP20339 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB5AP20339 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB5AP20339 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB5AP20339 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB5AP20339 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB5AP20339 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB5AP20339 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB5AP20339 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAB5AP20339 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAB5AP20339 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAB5AP20339 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAB5AP20339 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAB5AP20339 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms