Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB4AP20338 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB4AP20338 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB4AP20338 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB4AP20338 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB4AP20338 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB4AP20338 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB4AP20338 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB4AP20338 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB4AP20338 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB4AP20338 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB4AP20338 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB4AP20338 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB4AP20338 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB4AP20338 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB4AP20338 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB4AP20338 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB4AP20338 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB4AP20338 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB4AP20338 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB4AP20338 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB4AP20338 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB4AP20338 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB4AP20338 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB4AP20338 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB4AP20338 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.66
RAB4AP20338 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB4AP20338 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB4AP20338 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB4AP20338 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB4AP20338 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB4AP20338 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB4AP20338 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB4AP20338 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB4AP20338 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB4AP20338 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB4AP20338 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB4AP20338 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB4AP20338 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB4AP20338 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB4AP20338 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB4AP20338 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB4AP20338 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB4AP20338 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB4AP20338 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB4AP20338 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB4AP20338 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB4AP20338 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB4AP20338 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB4AP20338 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB4AP20338 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB4AP20338 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB4AP20338 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB4AP20338 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB4AP20338 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB4AP20338 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB4AP20338 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB4AP20338 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB4AP20338 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB4AP20338 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB4AP20338 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB4AP20338 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB4AP20338 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB4AP20338 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB4AP20338 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB4AP20338 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB4AP20338 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB4AP20338 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RAB4AP20338 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RAB4AP20338 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB4AP20338 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB4AP20338 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB4AP20338 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB4AP20338 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB4AP20338 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB4AP20338 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB4AP20338 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB4AP20338 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB4AP20338 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB4AP20338 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB4AP20338 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB4AP20338 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB4AP20338 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB4AP20338 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB4AP20338 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB4AP20338 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB4AP20338 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB4AP20338 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB4AP20338 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB4AP20338 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB4AP20338 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB4AP20338 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB4AP20338 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB4AP20338 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB4AP20338 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB4AP20338 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB4AP20338 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB4AP20338 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB4AP20338 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB4AP20338 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms