Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATP2B1P20020 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP2B1P20020 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP2B1P20020 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP2B1P20020 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP2B1P20020 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP2B1P20020 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATP2B1P20020 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP2B1P20020 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP2B1P20020 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP2B1P20020 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ATP2B1P20020 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATP2B1P20020 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATP2B1P20020 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATP2B1P20020 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATP2B1P20020 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATP2B1P20020 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATP2B1P20020 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATP2B1P20020 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATP2B1P20020 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATP2B1P20020 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATP2B1P20020 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATP2B1P20020 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATP2B1P20020 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATP2B1P20020 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATP2B1P20020 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATP2B1P20020 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATP2B1P20020 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATP2B1P20020 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATP2B1P20020 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATP2B1P20020 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATP2B1P20020 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATP2B1P20020 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATP2B1P20020 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATP2B1P20020 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATP2B1P20020 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATP2B1P20020 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATP2B1P20020 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATP2B1P20020 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATP2B1P20020 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATP2B1P20020 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATP2B1P20020 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATP2B1P20020 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATP2B1P20020 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATP2B1P20020 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATP2B1P20020 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATP2B1P20020 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
ATP2B1P20020 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
ATP2B1P20020 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29■■■□□ 2.23
ATP2B1P20020 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29■■■□□ 2.23
ATP2B1P20020 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATP2B1P20020 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATP2B1P20020 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATP2B1P20020 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATP2B1P20020 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATP2B1P20020 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATP2B1P20020 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATP2B1P20020 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATP2B1P20020 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATP2B1P20020 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATP2B1P20020 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATP2B1P20020 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATP2B1P20020 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATP2B1P20020 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATP2B1P20020 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATP2B1P20020 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATP2B1P20020 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ATP2B1P20020 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
ATP2B1P20020 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATP2B1P20020 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATP2B1P20020 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATP2B1P20020 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATP2B1P20020 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATP2B1P20020 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
ATP2B1P20020 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATP2B1P20020 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATP2B1P20020 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATP2B1P20020 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATP2B1P20020 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATP2B1P20020 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATP2B1P20020 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATP2B1P20020 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
ATP2B1P20020 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ATP2B1P20020 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ATP2B1P20020 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
ATP2B1P20020 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ATP2B1P20020 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ATP2B1P20020 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATP2B1P20020 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATP2B1P20020 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP2B1P20020 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP2B1P20020 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP2B1P20020 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP2B1P20020 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP2B1P20020 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP2B1P20020 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP2B1P20020 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP2B1P20020 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP2B1P20020 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP2B1P20020 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms