Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VCLP18206 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
VCLP18206 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VCLP18206 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VCLP18206 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VCLP18206 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
VCLP18206 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VCLP18206 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VCLP18206 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VCLP18206 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VCLP18206 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VCLP18206 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VCLP18206 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VCLP18206 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VCLP18206 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VCLP18206 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
VCLP18206 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
VCLP18206 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VCLP18206 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VCLP18206 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VCLP18206 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VCLP18206 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VCLP18206 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VCLP18206 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
VCLP18206 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
VCLP18206 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
VCLP18206 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
VCLP18206 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
VCLP18206 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
VCLP18206 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
VCLP18206 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
VCLP18206 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
VCLP18206 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VCLP18206 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VCLP18206 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VCLP18206 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VCLP18206 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VCLP18206 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VCLP18206 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VCLP18206 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VCLP18206 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VCLP18206 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VCLP18206 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VCLP18206 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VCLP18206 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
VCLP18206 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VCLP18206 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VCLP18206 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VCLP18206 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
VCLP18206 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
VCLP18206 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
VCLP18206 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VCLP18206 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VCLP18206 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VCLP18206 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VCLP18206 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VCLP18206 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VCLP18206 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VCLP18206 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VCLP18206 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VCLP18206 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VCLP18206 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VCLP18206 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VCLP18206 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VCLP18206 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VCLP18206 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VCLP18206 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VCLP18206 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VCLP18206 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VCLP18206 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VCLP18206 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
VCLP18206 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
VCLP18206 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VCLP18206 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VCLP18206 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VCLP18206 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
VCLP18206 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
VCLP18206 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VCLP18206 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VCLP18206 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VCLP18206 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VCLP18206 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VCLP18206 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VCLP18206 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
VCLP18206 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VCLP18206 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VCLP18206 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VCLP18206 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VCLP18206 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VCLP18206 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VCLP18206 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VCLP18206 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VCLP18206 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VCLP18206 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VCLP18206 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VCLP18206 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VCLP18206 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VCLP18206 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VCLP18206 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VCLP18206 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms