Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTLA4P16410 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTLA4P16410 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTLA4P16410 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTLA4P16410 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTLA4P16410 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTLA4P16410 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTLA4P16410 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTLA4P16410 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTLA4P16410 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTLA4P16410 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTLA4P16410 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTLA4P16410 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTLA4P16410 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTLA4P16410 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTLA4P16410 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTLA4P16410 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTLA4P16410 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTLA4P16410 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTLA4P16410 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CTLA4P16410 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTLA4P16410 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTLA4P16410 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTLA4P16410 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTLA4P16410 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTLA4P16410 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTLA4P16410 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTLA4P16410 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTLA4P16410 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTLA4P16410 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTLA4P16410 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTLA4P16410 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTLA4P16410 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTLA4P16410 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTLA4P16410 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTLA4P16410 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTLA4P16410 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTLA4P16410 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTLA4P16410 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTLA4P16410 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTLA4P16410 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTLA4P16410 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTLA4P16410 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTLA4P16410 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CTLA4P16410 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTLA4P16410 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTLA4P16410 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CTLA4P16410 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTLA4P16410 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTLA4P16410 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTLA4P16410 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTLA4P16410 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTLA4P16410 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTLA4P16410 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTLA4P16410 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTLA4P16410 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTLA4P16410 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTLA4P16410 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTLA4P16410 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTLA4P16410 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms