Protein–RNA interactions for Protein: P11171

EPB41, Protein 4.1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41P11171 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EPB41P11171 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EPB41P11171 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EPB41P11171 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EPB41P11171 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EPB41P11171 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EPB41P11171 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EPB41P11171 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EPB41P11171 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EPB41P11171 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EPB41P11171 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EPB41P11171 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EPB41P11171 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EPB41P11171 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EPB41P11171 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EPB41P11171 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EPB41P11171 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EPB41P11171 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EPB41P11171 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EPB41P11171 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EPB41P11171 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
EPB41P11171 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EPB41P11171 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EPB41P11171 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EPB41P11171 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EPB41P11171 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EPB41P11171 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
EPB41P11171 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EPB41P11171 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EPB41P11171 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EPB41P11171 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
EPB41P11171 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EPB41P11171 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EPB41P11171 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EPB41P11171 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EPB41P11171 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EPB41P11171 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EPB41P11171 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
EPB41P11171 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EPB41P11171 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EPB41P11171 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EPB41P11171 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EPB41P11171 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
EPB41P11171 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
EPB41P11171 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
EPB41P11171 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
EPB41P11171 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EPB41P11171 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EPB41P11171 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EPB41P11171 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EPB41P11171 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EPB41P11171 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EPB41P11171 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EPB41P11171 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EPB41P11171 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EPB41P11171 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EPB41P11171 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EPB41P11171 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EPB41P11171 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
EPB41P11171 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EPB41P11171 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EPB41P11171 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EPB41P11171 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
EPB41P11171 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
EPB41P11171 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
EPB41P11171 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
EPB41P11171 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
EPB41P11171 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
EPB41P11171 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
EPB41P11171 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EPB41P11171 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
EPB41P11171 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
EPB41P11171 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
EPB41P11171 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EPB41P11171 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
EPB41P11171 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EPB41P11171 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EPB41P11171 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
EPB41P11171 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
EPB41P11171 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EPB41P11171 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EPB41P11171 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EPB41P11171 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
EPB41P11171 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EPB41P11171 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EPB41P11171 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EPB41P11171 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
EPB41P11171 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
EPB41P11171 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EPB41P11171 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EPB41P11171 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EPB41P11171 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EPB41P11171 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.56■■■□□ 2
EPB41P11171 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
EPB41P11171 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EPB41P11171 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
EPB41P11171 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EPB41P11171 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EPB41P11171 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
EPB41P11171 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms