Protein–RNA interactions for Protein: P10144

GZMB, Granzyme B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GZMBP10144 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GZMBP10144 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GZMBP10144 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GZMBP10144 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GZMBP10144 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GZMBP10144 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GZMBP10144 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GZMBP10144 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GZMBP10144 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GZMBP10144 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GZMBP10144 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GZMBP10144 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GZMBP10144 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GZMBP10144 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GZMBP10144 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GZMBP10144 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GZMBP10144 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GZMBP10144 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GZMBP10144 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GZMBP10144 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GZMBP10144 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GZMBP10144 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GZMBP10144 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GZMBP10144 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GZMBP10144 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GZMBP10144 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GZMBP10144 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GZMBP10144 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GZMBP10144 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GZMBP10144 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GZMBP10144 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GZMBP10144 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GZMBP10144 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GZMBP10144 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GZMBP10144 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GZMBP10144 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GZMBP10144 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GZMBP10144 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GZMBP10144 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GZMBP10144 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GZMBP10144 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GZMBP10144 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GZMBP10144 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GZMBP10144 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GZMBP10144 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GZMBP10144 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GZMBP10144 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GZMBP10144 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GZMBP10144 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
GZMBP10144 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GZMBP10144 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GZMBP10144 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GZMBP10144 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GZMBP10144 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GZMBP10144 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GZMBP10144 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GZMBP10144 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GZMBP10144 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GZMBP10144 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GZMBP10144 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GZMBP10144 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GZMBP10144 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GZMBP10144 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
GZMBP10144 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GZMBP10144 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GZMBP10144 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GZMBP10144 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GZMBP10144 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GZMBP10144 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GZMBP10144 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GZMBP10144 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GZMBP10144 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GZMBP10144 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GZMBP10144 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GZMBP10144 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GZMBP10144 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GZMBP10144 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GZMBP10144 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GZMBP10144 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GZMBP10144 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GZMBP10144 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GZMBP10144 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GZMBP10144 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GZMBP10144 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GZMBP10144 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GZMBP10144 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GZMBP10144 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GZMBP10144 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GZMBP10144 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GZMBP10144 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GZMBP10144 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GZMBP10144 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GZMBP10144 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GZMBP10144 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GZMBP10144 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GZMBP10144 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GZMBP10144 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GZMBP10144 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GZMBP10144 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GZMBP10144 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms