Protein–RNA interactions for Protein: P0DM63

NPIPA8, Nuclear pore complex-interacting protein family member A8, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA8P0DM63 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NPIPA8P0DM63 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPIPA8P0DM63 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPIPA8P0DM63 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPIPA8P0DM63 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPIPA8P0DM63 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPIPA8P0DM63 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPIPA8P0DM63 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPIPA8P0DM63 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPIPA8P0DM63 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPIPA8P0DM63 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPIPA8P0DM63 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPIPA8P0DM63 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPIPA8P0DM63 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPIPA8P0DM63 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPIPA8P0DM63 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPIPA8P0DM63 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPIPA8P0DM63 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPIPA8P0DM63 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPIPA8P0DM63 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPIPA8P0DM63 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPIPA8P0DM63 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPIPA8P0DM63 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPIPA8P0DM63 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPIPA8P0DM63 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPIPA8P0DM63 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPIPA8P0DM63 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPIPA8P0DM63 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NPIPA8P0DM63 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPIPA8P0DM63 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPIPA8P0DM63 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPIPA8P0DM63 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPIPA8P0DM63 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPIPA8P0DM63 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPIPA8P0DM63 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPIPA8P0DM63 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPIPA8P0DM63 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPIPA8P0DM63 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPIPA8P0DM63 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPIPA8P0DM63 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPIPA8P0DM63 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPIPA8P0DM63 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPIPA8P0DM63 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPIPA8P0DM63 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPIPA8P0DM63 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPIPA8P0DM63 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPIPA8P0DM63 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPIPA8P0DM63 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPIPA8P0DM63 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPIPA8P0DM63 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NPIPA8P0DM63 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
NPIPA8P0DM63 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPIPA8P0DM63 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPIPA8P0DM63 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPIPA8P0DM63 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPIPA8P0DM63 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NPIPA8P0DM63 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPIPA8P0DM63 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPIPA8P0DM63 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPIPA8P0DM63 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPIPA8P0DM63 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPIPA8P0DM63 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPIPA8P0DM63 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPIPA8P0DM63 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPIPA8P0DM63 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPIPA8P0DM63 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPIPA8P0DM63 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPIPA8P0DM63 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPIPA8P0DM63 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NPIPA8P0DM63 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPIPA8P0DM63 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPIPA8P0DM63 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPIPA8P0DM63 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPIPA8P0DM63 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPIPA8P0DM63 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPIPA8P0DM63 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPIPA8P0DM63 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPIPA8P0DM63 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPIPA8P0DM63 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPIPA8P0DM63 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPIPA8P0DM63 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPIPA8P0DM63 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPIPA8P0DM63 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPIPA8P0DM63 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPIPA8P0DM63 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPIPA8P0DM63 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NPIPA8P0DM63 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPIPA8P0DM63 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPIPA8P0DM63 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPIPA8P0DM63 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPIPA8P0DM63 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NPIPA8P0DM63 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPIPA8P0DM63 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPIPA8P0DM63 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
NPIPA8P0DM63 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPIPA8P0DM63 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPIPA8P0DM63 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPIPA8P0DM63 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NPIPA8P0DM63 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPIPA8P0DM63 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms