Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC166P0CW27 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC166P0CW27 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC166P0CW27 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC166P0CW27 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC166P0CW27 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC166P0CW27 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC166P0CW27 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC166P0CW27 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC166P0CW27 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC166P0CW27 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC166P0CW27 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC166P0CW27 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC166P0CW27 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC166P0CW27 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC166P0CW27 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC166P0CW27 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC166P0CW27 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC166P0CW27 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC166P0CW27 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC166P0CW27 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC166P0CW27 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC166P0CW27 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC166P0CW27 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC166P0CW27 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC166P0CW27 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC166P0CW27 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC166P0CW27 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC166P0CW27 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC166P0CW27 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC166P0CW27 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC166P0CW27 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC166P0CW27 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC166P0CW27 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC166P0CW27 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC166P0CW27 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC166P0CW27 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC166P0CW27 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC166P0CW27 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC166P0CW27 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC166P0CW27 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC166P0CW27 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC166P0CW27 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC166P0CW27 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC166P0CW27 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC166P0CW27 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC166P0CW27 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC166P0CW27 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC166P0CW27 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC166P0CW27 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC166P0CW27 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC166P0CW27 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC166P0CW27 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC166P0CW27 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC166P0CW27 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC166P0CW27 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC166P0CW27 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC166P0CW27 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC166P0CW27 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC166P0CW27 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC166P0CW27 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.6
CCDC166P0CW27 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC166P0CW27 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC166P0CW27 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC166P0CW27 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC166P0CW27 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC166P0CW27 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC166P0CW27 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC166P0CW27 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC166P0CW27 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC166P0CW27 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC166P0CW27 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC166P0CW27 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC166P0CW27 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC166P0CW27 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC166P0CW27 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC166P0CW27 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC166P0CW27 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC166P0CW27 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC166P0CW27 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC166P0CW27 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC166P0CW27 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC166P0CW27 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC166P0CW27 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC166P0CW27 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC166P0CW27 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC166P0CW27 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC166P0CW27 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC166P0CW27 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC166P0CW27 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC166P0CW27 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC166P0CW27 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC166P0CW27 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC166P0CW27 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC166P0CW27 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC166P0CW27 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC166P0CW27 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC166P0CW27 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC166P0CW27 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC166P0CW27 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms